Protein–RNA interactions for Protein: Q12208

USB1, U6 snRNA phosphodiesterase, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 290 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
USB1Q12208 YLR256W-AYLR256W-A 1323 nt3.05□□□□□ -1.92
USB1Q12208 YML040WYML040W 1323 nt3.05□□□□□ -1.92
USB1Q12208 YML045W-AYML045W-A 1323 nt3.05□□□□□ -1.92
USB1Q12208 YMR051CYMR051C 1323 nt3.05□□□□□ -1.92
USB1Q12208 YNL054W-AYNL054W-A 1323 nt3.05□□□□□ -1.92
USB1Q12208 YOL103W-AYOL103W-A 1323 nt3.05□□□□□ -1.92
USB1Q12208 YPL257W-AYPL257W-A 1323 nt3.05□□□□□ -1.92
USB1Q12208 YPR137C-AYPR137C-A 1323 nt3.05□□□□□ -1.92
USB1Q12208 YPR158C-CYPR158C-C 1323 nt3.05□□□□□ -1.92
USB1Q12208 YCR101CYCR101C 549 nt3.05□□□□□ -1.92
USB1Q12208 BSC1YDL037C 987 nt3.05□□□□□ -1.92
USB1Q12208 YDR526CYDR526C 471 nt3.05□□□□□ -1.92
USB1Q12208 GTF1YGR102C 552 nt3.05□□□□□ -1.92
USB1Q12208 IZH2YOL002C 954 nt3.05□□□□□ -1.92
USB1Q12208 TIR2YOR010C 756 nt3.05□□□□□ -1.92
USB1Q12208 TMC1YOR052C 453 nt3.05□□□□□ -1.92
USB1Q12208 TMA16YOR252W 537 nt3.05□□□□□ -1.92
USB1Q12208 RRP36YOR287C 903 nt3.05□□□□□ -1.92
USB1Q12208 YPR108W-AYPR108W-A 213 nt3.05□□□□□ -1.92
USB1Q12208 CTR1YPR124W 1221 nt3.05□□□□□ -1.92
USB1Q12208 RRP5YMR229C 5190 nt3.05□□□□□ -1.92
USB1Q12208 MUP3YHL036W 1641 nt3.04□□□□□ -1.92
USB1Q12208 APN2YBL019W 1563 nt3.04□□□□□ -1.92
USB1Q12208 YGR161W-CYGR161W-C 279 nt3.04□□□□□ -1.92
USB1Q12208 YHR214C-EYHR214C-E 300 nt3.04□□□□□ -1.92
USB1Q12208 YJR037WYJR037W 384 nt3.04□□□□□ -1.92
USB1Q12208 ERP1YAR002C-A 660 nt3.04□□□□□ -1.92
USB1Q12208 IRC25YLR021W 540 nt3.04□□□□□ -1.92
USB1Q12208 YAR070CYAR070C 300 nt3.04□□□□□ -1.92
USB1Q12208 TIF34YMR146C 1044 nt3.04□□□□□ -1.92
USB1Q12208 MED7YOL135C 669 nt3.04□□□□□ -1.92
USB1Q12208 RIB4YOL143C 510 nt3.04□□□□□ -1.92
USB1Q12208 SKN7YHR206W 1869 nt3.04□□□□□ -1.92
USB1Q12208 FAS1YKL182W 6156 nt3.04□□□□□ -1.92
USB1Q12208 TSR1YDL060W 2367 nt3.04□□□□□ -1.92
USB1Q12208 GAT2YMR136W 1683 nt3.04□□□□□ -1.92
USB1Q12208 GPI13YLL031C 3054 nt3.04□□□□□ -1.92
USB1Q12208 YVC1YOR087W 2028 nt3.03□□□□□ -1.92
USB1Q12208 TED1YIL039W 1422 nt3.03□□□□□ -1.92
USB1Q12208 CIT1YNR001C 1440 nt3.03□□□□□ -1.92
USB1Q12208 APM1YPL259C 1428 nt3.03□□□□□ -1.92
USB1Q12208 PRP22YER013W 3438 nt3.03□□□□□ -1.92
USB1Q12208 YEL032C-AYEL032C-A 162 nt3.03□□□□□ -1.92
USB1Q12208 RPS8BYER102W 603 nt3.03□□□□□ -1.92
USB1Q12208 OKP1YGR179C 1221 nt3.03□□□□□ -1.92
USB1Q12208 ERV29YGR284C 933 nt3.03□□□□□ -1.92
USB1Q12208 LSM1YJL124C 519 nt3.03□□□□□ -1.92
USB1Q12208 RPS8AYBL072C 603 nt3.03□□□□□ -1.92
USB1Q12208 VAM10YOR068C 345 nt3.03□□□□□ -1.92
USB1Q12208 COA2YPL189C-A 207 nt3.03□□□□□ -1.92
USB1Q12208 ARO7YPR060C 771 nt3.03□□□□□ -1.92
USB1Q12208 ASI1YMR119W 1875 nt3.03□□□□□ -1.93
USB1Q12208 ULP1YPL020C 1866 nt3.03□□□□□ -1.93
USB1Q12208 FLO9YAL063C 3969 nt3.02□□□□□ -1.93
USB1Q12208 YPR022CYPR022C 3402 nt3.02□□□□□ -1.93
USB1Q12208 YCL068CYCL068C 783 nt3.02□□□□□ -1.93
USB1Q12208 RPA14YDR156W 414 nt3.02□□□□□ -1.93
USB1Q12208 YDR249CYDR249C 1122 nt3.02□□□□□ -1.93
USB1Q12208 RPS9BYBR189W 588 nt3.02□□□□□ -1.93
USB1Q12208 PFK26YIL107C 2484 nt3.02□□□□□ -1.93
USB1Q12208 YMR018WYMR018W 1545 nt3.02□□□□□ -1.93
USB1Q12208 TRS120YDR407C 3870 nt3.02□□□□□ -1.93
USB1Q12208 YGR117CYGR117C 1431 nt3.02□□□□□ -1.93
USB1Q12208 RAD2YGR258C 3096 nt3.01□□□□□ -1.93
USB1Q12208 NSP1YJL041W 2472 nt3.01□□□□□ -1.93
USB1Q12208 RAD5YLR032W 3510 nt3.01□□□□□ -1.93
USB1Q12208 CUE3YGL110C 1875 nt3.01□□□□□ -1.93
USB1Q12208 NEM1YHR004C 1341 nt3.01□□□□□ -1.93
USB1Q12208 BCD1YHR040W 1101 nt3.01□□□□□ -1.93
USB1Q12208 GMH1YKR030W 822 nt3.01□□□□□ -1.93
USB1Q12208 YKR075CYKR075C 924 nt3.01□□□□□ -1.93
USB1Q12208 SRN2YLR119W 642 nt3.01□□□□□ -1.93
USB1Q12208 YOR238WYOR238W 912 nt3.01□□□□□ -1.93
USB1Q12208 MGA1YGR249W 1371 nt3□□□□□ -1.93
USB1Q12208 RNY1YPL123C 1305 nt3□□□□□ -1.93
USB1Q12208 YAK1YJL141C 2424 nt3□□□□□ -1.93
USB1Q12208 LRG1YDL240W 3054 nt3□□□□□ -1.93
USB1Q12208 RSC1YGR056W 2787 nt3□□□□□ -1.93
USB1Q12208 DOS2YDR068W 933 nt3□□□□□ -1.93
USB1Q12208 HAT2YEL056W 1206 nt3□□□□□ -1.93
USB1Q12208 SDT1YGL224C 843 nt3□□□□□ -1.93
USB1Q12208 VTA1YLR181C 993 nt3□□□□□ -1.93
USB1Q12208 RPS28BYLR264W 204 nt3□□□□□ -1.93
USB1Q12208 TOP1YOL006C 2310 nt3□□□□□ -1.93
USB1Q12208 BAR1YIL015W 1764 nt3□□□□□ -1.93
USB1Q12208 TDA1YMR291W 1761 nt3□□□□□ -1.93
USB1Q12208 MDM38YOL027C 1722 nt2.99□□□□□ -1.93
USB1Q12208 RRP1YDR087C 837 nt2.99□□□□□ -1.93
USB1Q12208 PHO92YDR374C 921 nt2.99□□□□□ -1.93
USB1Q12208 YHR137C-AYHR137C-A 651 nt2.99□□□□□ -1.93
USB1Q12208 tV(CAC)DtV(CAC)D 73 nt2.99□□□□□ -1.93
USB1Q12208 tV(CAC)HtV(CAC)H 73 nt2.99□□□□□ -1.93
USB1Q12208 YIL047C-AYIL047C-A 369 nt2.99□□□□□ -1.93
USB1Q12208 REE1YJL217W 597 nt2.99□□□□□ -1.93
USB1Q12208 CPR3YML078W 549 nt2.99□□□□□ -1.93
USB1Q12208 PLP2YOR281C 861 nt2.99□□□□□ -1.93
USB1Q12208 MIC60YKR016W 1623 nt2.99□□□□□ -1.93
USB1Q12208 ALA1YOR335C 2877 nt2.99□□□□□ -1.93
USB1Q12208 KIN3YAR018C 1308 nt2.98□□□□□ -1.93
USB1Q12208 ATG26YLR189C 3597 nt2.98□□□□□ -1.93
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