Protein–RNA interactions for Protein: Q11201

ST3GAL1, CMP-N-acetylneuraminate-beta-galactosamide-alpha-2,3-sialyltransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ST3GAL1Q11201 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ST3GAL1Q11201 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ST3GAL1Q11201 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ST3GAL1Q11201 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ST3GAL1Q11201 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ST3GAL1Q11201 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ST3GAL1Q11201 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ST3GAL1Q11201 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ST3GAL1Q11201 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ST3GAL1Q11201 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
ST3GAL1Q11201 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
ST3GAL1Q11201 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
ST3GAL1Q11201 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ST3GAL1Q11201 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
ST3GAL1Q11201 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ST3GAL1Q11201 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
ST3GAL1Q11201 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
ST3GAL1Q11201 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
ST3GAL1Q11201 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
ST3GAL1Q11201 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
ST3GAL1Q11201 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ST3GAL1Q11201 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ST3GAL1Q11201 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
ST3GAL1Q11201 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ST3GAL1Q11201 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ST3GAL1Q11201 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ST3GAL1Q11201 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ST3GAL1Q11201 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ST3GAL1Q11201 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ST3GAL1Q11201 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ST3GAL1Q11201 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ST3GAL1Q11201 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ST3GAL1Q11201 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ST3GAL1Q11201 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ST3GAL1Q11201 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ST3GAL1Q11201 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ST3GAL1Q11201 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ST3GAL1Q11201 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ST3GAL1Q11201 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ST3GAL1Q11201 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ST3GAL1Q11201 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ST3GAL1Q11201 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ST3GAL1Q11201 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ST3GAL1Q11201 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ST3GAL1Q11201 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ST3GAL1Q11201 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ST3GAL1Q11201 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ST3GAL1Q11201 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ST3GAL1Q11201 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ST3GAL1Q11201 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ST3GAL1Q11201 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ST3GAL1Q11201 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ST3GAL1Q11201 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ST3GAL1Q11201 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ST3GAL1Q11201 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ST3GAL1Q11201 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ST3GAL1Q11201 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ST3GAL1Q11201 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ST3GAL1Q11201 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ST3GAL1Q11201 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ST3GAL1Q11201 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ST3GAL1Q11201 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ST3GAL1Q11201 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ST3GAL1Q11201 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ST3GAL1Q11201 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ST3GAL1Q11201 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ST3GAL1Q11201 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ST3GAL1Q11201 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ST3GAL1Q11201 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ST3GAL1Q11201 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ST3GAL1Q11201 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ST3GAL1Q11201 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ST3GAL1Q11201 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ST3GAL1Q11201 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ST3GAL1Q11201 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ST3GAL1Q11201 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ST3GAL1Q11201 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ST3GAL1Q11201 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ST3GAL1Q11201 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ST3GAL1Q11201 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ST3GAL1Q11201 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ST3GAL1Q11201 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
ST3GAL1Q11201 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ST3GAL1Q11201 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ST3GAL1Q11201 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ST3GAL1Q11201 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ST3GAL1Q11201 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ST3GAL1Q11201 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ST3GAL1Q11201 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ST3GAL1Q11201 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ST3GAL1Q11201 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ST3GAL1Q11201 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ST3GAL1Q11201 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ST3GAL1Q11201 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ST3GAL1Q11201 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ST3GAL1Q11201 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ST3GAL1Q11201 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ST3GAL1Q11201 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ST3GAL1Q11201 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ST3GAL1Q11201 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms