Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2I5

IFFO1, Intermediate filament family orphan 1, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFFO1Q0D2I5 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
IFFO1Q0D2I5 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
IFFO1Q0D2I5 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
IFFO1Q0D2I5 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
IFFO1Q0D2I5 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
IFFO1Q0D2I5 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
IFFO1Q0D2I5 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
IFFO1Q0D2I5 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
IFFO1Q0D2I5 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
IFFO1Q0D2I5 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
IFFO1Q0D2I5 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
IFFO1Q0D2I5 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
IFFO1Q0D2I5 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
IFFO1Q0D2I5 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
IFFO1Q0D2I5 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
IFFO1Q0D2I5 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
IFFO1Q0D2I5 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
IFFO1Q0D2I5 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
IFFO1Q0D2I5 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
IFFO1Q0D2I5 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
IFFO1Q0D2I5 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
IFFO1Q0D2I5 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
IFFO1Q0D2I5 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
IFFO1Q0D2I5 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
IFFO1Q0D2I5 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
IFFO1Q0D2I5 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
IFFO1Q0D2I5 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
IFFO1Q0D2I5 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
IFFO1Q0D2I5 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
IFFO1Q0D2I5 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
IFFO1Q0D2I5 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
IFFO1Q0D2I5 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
IFFO1Q0D2I5 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
IFFO1Q0D2I5 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
IFFO1Q0D2I5 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
IFFO1Q0D2I5 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
IFFO1Q0D2I5 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
IFFO1Q0D2I5 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
IFFO1Q0D2I5 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
IFFO1Q0D2I5 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
IFFO1Q0D2I5 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
IFFO1Q0D2I5 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
IFFO1Q0D2I5 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
IFFO1Q0D2I5 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
IFFO1Q0D2I5 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
IFFO1Q0D2I5 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
IFFO1Q0D2I5 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
IFFO1Q0D2I5 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
IFFO1Q0D2I5 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
IFFO1Q0D2I5 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
IFFO1Q0D2I5 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
IFFO1Q0D2I5 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
IFFO1Q0D2I5 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
IFFO1Q0D2I5 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
IFFO1Q0D2I5 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
IFFO1Q0D2I5 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
IFFO1Q0D2I5 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
IFFO1Q0D2I5 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
IFFO1Q0D2I5 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
IFFO1Q0D2I5 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
IFFO1Q0D2I5 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
IFFO1Q0D2I5 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
IFFO1Q0D2I5 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
IFFO1Q0D2I5 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
IFFO1Q0D2I5 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
IFFO1Q0D2I5 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
IFFO1Q0D2I5 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
IFFO1Q0D2I5 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
IFFO1Q0D2I5 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
IFFO1Q0D2I5 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
IFFO1Q0D2I5 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
IFFO1Q0D2I5 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC22.2■■□□□ 1.15
IFFO1Q0D2I5 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
IFFO1Q0D2I5 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
IFFO1Q0D2I5 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
IFFO1Q0D2I5 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
IFFO1Q0D2I5 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
IFFO1Q0D2I5 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
IFFO1Q0D2I5 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
IFFO1Q0D2I5 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
IFFO1Q0D2I5 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
IFFO1Q0D2I5 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
IFFO1Q0D2I5 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
IFFO1Q0D2I5 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
IFFO1Q0D2I5 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
IFFO1Q0D2I5 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
IFFO1Q0D2I5 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
IFFO1Q0D2I5 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
IFFO1Q0D2I5 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
IFFO1Q0D2I5 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
IFFO1Q0D2I5 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
IFFO1Q0D2I5 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
IFFO1Q0D2I5 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
IFFO1Q0D2I5 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
IFFO1Q0D2I5 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
IFFO1Q0D2I5 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
IFFO1Q0D2I5 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
IFFO1Q0D2I5 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
IFFO1Q0D2I5 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
IFFO1Q0D2I5 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms