Protein–RNA interactions for Protein: Q08AH1

ACSM1, Acyl-coenzyme A synthetase ACSM1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 577 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACSM1Q08AH1 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ACSM1Q08AH1 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ACSM1Q08AH1 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ACSM1Q08AH1 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ACSM1Q08AH1 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ACSM1Q08AH1 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ACSM1Q08AH1 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ACSM1Q08AH1 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ACSM1Q08AH1 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ACSM1Q08AH1 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ACSM1Q08AH1 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ACSM1Q08AH1 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ACSM1Q08AH1 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ACSM1Q08AH1 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ACSM1Q08AH1 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ACSM1Q08AH1 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
ACSM1Q08AH1 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ACSM1Q08AH1 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ACSM1Q08AH1 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ACSM1Q08AH1 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ACSM1Q08AH1 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ACSM1Q08AH1 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ACSM1Q08AH1 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ACSM1Q08AH1 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ACSM1Q08AH1 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ACSM1Q08AH1 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ACSM1Q08AH1 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ACSM1Q08AH1 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ACSM1Q08AH1 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ACSM1Q08AH1 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ACSM1Q08AH1 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ACSM1Q08AH1 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ACSM1Q08AH1 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ACSM1Q08AH1 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ACSM1Q08AH1 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ACSM1Q08AH1 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
ACSM1Q08AH1 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ACSM1Q08AH1 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ACSM1Q08AH1 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ACSM1Q08AH1 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ACSM1Q08AH1 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ACSM1Q08AH1 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ACSM1Q08AH1 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ACSM1Q08AH1 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ACSM1Q08AH1 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ACSM1Q08AH1 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ACSM1Q08AH1 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ACSM1Q08AH1 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ACSM1Q08AH1 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ACSM1Q08AH1 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ACSM1Q08AH1 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ACSM1Q08AH1 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ACSM1Q08AH1 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ACSM1Q08AH1 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ACSM1Q08AH1 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ACSM1Q08AH1 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ACSM1Q08AH1 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ACSM1Q08AH1 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ACSM1Q08AH1 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ACSM1Q08AH1 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ACSM1Q08AH1 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ACSM1Q08AH1 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ACSM1Q08AH1 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ACSM1Q08AH1 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ACSM1Q08AH1 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ACSM1Q08AH1 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ACSM1Q08AH1 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ACSM1Q08AH1 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ACSM1Q08AH1 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ACSM1Q08AH1 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ACSM1Q08AH1 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ACSM1Q08AH1 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ACSM1Q08AH1 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ACSM1Q08AH1 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ACSM1Q08AH1 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ACSM1Q08AH1 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ACSM1Q08AH1 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ACSM1Q08AH1 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ACSM1Q08AH1 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ACSM1Q08AH1 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ACSM1Q08AH1 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ACSM1Q08AH1 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ACSM1Q08AH1 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ACSM1Q08AH1 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ACSM1Q08AH1 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ACSM1Q08AH1 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ACSM1Q08AH1 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ACSM1Q08AH1 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ACSM1Q08AH1 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ACSM1Q08AH1 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ACSM1Q08AH1 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ACSM1Q08AH1 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ACSM1Q08AH1 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ACSM1Q08AH1 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ACSM1Q08AH1 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ACSM1Q08AH1 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
ACSM1Q08AH1 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ACSM1Q08AH1 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ACSM1Q08AH1 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ACSM1Q08AH1 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms