Protein–RNA interactions for Protein: Q08289

CACNB2, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB2Q08289 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CACNB2Q08289 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CACNB2Q08289 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CACNB2Q08289 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CACNB2Q08289 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CACNB2Q08289 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CACNB2Q08289 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CACNB2Q08289 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CACNB2Q08289 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CACNB2Q08289 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
CACNB2Q08289 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CACNB2Q08289 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
CACNB2Q08289 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
CACNB2Q08289 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CACNB2Q08289 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CACNB2Q08289 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CACNB2Q08289 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CACNB2Q08289 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CACNB2Q08289 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CACNB2Q08289 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CACNB2Q08289 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CACNB2Q08289 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
CACNB2Q08289 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CACNB2Q08289 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CACNB2Q08289 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CACNB2Q08289 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CACNB2Q08289 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CACNB2Q08289 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CACNB2Q08289 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CACNB2Q08289 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CACNB2Q08289 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CACNB2Q08289 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CACNB2Q08289 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CACNB2Q08289 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CACNB2Q08289 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CACNB2Q08289 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CACNB2Q08289 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CACNB2Q08289 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CACNB2Q08289 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CACNB2Q08289 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CACNB2Q08289 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CACNB2Q08289 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CACNB2Q08289 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CACNB2Q08289 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CACNB2Q08289 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CACNB2Q08289 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CACNB2Q08289 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CACNB2Q08289 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CACNB2Q08289 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CACNB2Q08289 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CACNB2Q08289 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CACNB2Q08289 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CACNB2Q08289 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CACNB2Q08289 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CACNB2Q08289 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CACNB2Q08289 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CACNB2Q08289 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CACNB2Q08289 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CACNB2Q08289 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
CACNB2Q08289 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CACNB2Q08289 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CACNB2Q08289 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CACNB2Q08289 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CACNB2Q08289 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CACNB2Q08289 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CACNB2Q08289 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CACNB2Q08289 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CACNB2Q08289 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CACNB2Q08289 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CACNB2Q08289 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CACNB2Q08289 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CACNB2Q08289 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CACNB2Q08289 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CACNB2Q08289 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CACNB2Q08289 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CACNB2Q08289 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
CACNB2Q08289 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CACNB2Q08289 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CACNB2Q08289 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CACNB2Q08289 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CACNB2Q08289 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
CACNB2Q08289 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CACNB2Q08289 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CACNB2Q08289 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
CACNB2Q08289 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CACNB2Q08289 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CACNB2Q08289 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CACNB2Q08289 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CACNB2Q08289 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CACNB2Q08289 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
CACNB2Q08289 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CACNB2Q08289 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CACNB2Q08289 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CACNB2Q08289 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CACNB2Q08289 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CACNB2Q08289 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CACNB2Q08289 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CACNB2Q08289 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CACNB2Q08289 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
CACNB2Q08289 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms