Protein–RNA interactions for Protein: Q08109

HRD1, ERAD-associated E3 ubiquitin-protein ligase HRD1, yeastyeast

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Length 551 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
HRD1Q08109 SUI3YPL237W 858 nt2.86□□□□□ -1.95
HRD1Q08109 YAT2YER024W 2772 nt2.86□□□□□ -1.95
HRD1Q08109 ACK1YDL203C 1872 nt2.86□□□□□ -1.95
HRD1Q08109 YDR089WYDR089W 2610 nt2.86□□□□□ -1.95
HRD1Q08109 UBP5YER144C 2418 nt2.85□□□□□ -1.95
HRD1Q08109 MRH4YGL064C 1686 nt2.85□□□□□ -1.95
HRD1Q08109 TAO3YIL129C 7131 nt2.85□□□□□ -1.95
HRD1Q08109 CPR1YDR155C 489 nt2.85□□□□□ -1.95
HRD1Q08109 YER165C-AYER165C-A 357 nt2.85□□□□□ -1.95
HRD1Q08109 OTU1YFL044C 906 nt2.85□□□□□ -1.95
HRD1Q08109 LIF1YGL090W 1266 nt2.85□□□□□ -1.95
HRD1Q08109 SKI8YGL213C 1194 nt2.85□□□□□ -1.95
HRD1Q08109 YLR154C-HYLR154C-H 132 nt2.85□□□□□ -1.95
HRD1Q08109 YLR156C-AYLR156C-A 132 nt2.85□□□□□ -1.95
HRD1Q08109 YLR157C-CYLR157C-C 132 nt2.85□□□□□ -1.95
HRD1Q08109 YLR159C-AYLR159C-A 132 nt2.85□□□□□ -1.95
HRD1Q08109 RAD33YML011C 534 nt2.85□□□□□ -1.95
HRD1Q08109 YBL029WYBL029W 1131 nt2.85□□□□□ -1.95
HRD1Q08109 RPL13BYMR142C 600 nt2.85□□□□□ -1.95
HRD1Q08109 TMA16YOR252W 537 nt2.85□□□□□ -1.95
HRD1Q08109 PLP2YOR281C 861 nt2.85□□□□□ -1.95
HRD1Q08109 YOR342CYOR342C 960 nt2.85□□□□□ -1.95
HRD1Q08109 CMR3YPR013C 954 nt2.85□□□□□ -1.95
HRD1Q08109 STP2YHR006W 1626 nt2.85□□□□□ -1.95
HRD1Q08109 TOP1YOL006C 2310 nt2.85□□□□□ -1.95
HRD1Q08109 ISM1YPL040C 3009 nt2.85□□□□□ -1.95
HRD1Q08109 YDR132CYDR132C 1488 nt2.84□□□□□ -1.95
HRD1Q08109 PRS5YOL061W 1491 nt2.84□□□□□ -1.95
HRD1Q08109 BUD4YJR092W 4344 nt2.84□□□□□ -1.95
HRD1Q08109 STU2YLR045C 2667 nt2.84□□□□□ -1.95
HRD1Q08109 NUP60YAR002W 1620 nt2.84□□□□□ -1.95
HRD1Q08109 YGL082WYGL082W 1146 nt2.84□□□□□ -1.95
HRD1Q08109 RPS21BYJL136C 264 nt2.84□□□□□ -1.95
HRD1Q08109 MCM1YMR043W 861 nt2.84□□□□□ -1.95
HRD1Q08109 YNL013CYNL013C 378 nt2.84□□□□□ -1.95
HRD1Q08109 MIF2YKL089W 1650 nt2.84□□□□□ -1.95
HRD1Q08109 GPI1YGR216C 1830 nt2.84□□□□□ -1.96
HRD1Q08109 PKH1YDR490C 2301 nt2.84□□□□□ -1.96
HRD1Q08109 FLO5YHR211W 3228 nt2.83□□□□□ -1.96
HRD1Q08109 YSP2YDR326C 4317 nt2.83□□□□□ -1.96
HRD1Q08109 PCL6YER059W 1263 nt2.83□□□□□ -1.96
HRD1Q08109 PUG1YER185W 912 nt2.83□□□□□ -1.96
HRD1Q08109 PXR1YGR280C 816 nt2.83□□□□□ -1.96
HRD1Q08109 SGN1YIR001C 753 nt2.83□□□□□ -1.96
HRD1Q08109 ERP1YAR002C-A 660 nt2.83□□□□□ -1.96
HRD1Q08109 VPS71YML041C 843 nt2.83□□□□□ -1.96
HRD1Q08109 SSO2YMR183C 888 nt2.83□□□□□ -1.96
HRD1Q08109 GIS2YNL255C 462 nt2.83□□□□□ -1.96
HRD1Q08109 BCS1YDR375C 1371 nt2.83□□□□□ -1.96
HRD1Q08109 PRP3YDR473C 1410 nt2.83□□□□□ -1.96
HRD1Q08109 AIM14YGL160W 1713 nt2.82□□□□□ -1.96
HRD1Q08109 YMR317WYMR317W 3423 nt2.82□□□□□ -1.96
HRD1Q08109 GCD7YLR291C 1146 nt2.82□□□□□ -1.96
HRD1Q08109 YOR186WYOR186W 435 nt2.82□□□□□ -1.96
HRD1Q08109 ARR1YPR199C 885 nt2.82□□□□□ -1.96
HRD1Q08109 NEM1YHR004C 1341 nt2.82□□□□□ -1.96
HRD1Q08109 HOS2YGL194C 1359 nt2.82□□□□□ -1.96
HRD1Q08109 YEL025CYEL025C 3567 nt2.82□□□□□ -1.96
HRD1Q08109 CDH1YGL003C 1701 nt2.82□□□□□ -1.96
HRD1Q08109 IME4YGL192W 1803 nt2.82□□□□□ -1.96
HRD1Q08109 PRM15YMR278W 1869 nt2.82□□□□□ -1.96
HRD1Q08109 CSR2YPR030W 3366 nt2.81□□□□□ -1.96
HRD1Q08109 DYN2YDR424C 279 nt2.81□□□□□ -1.96
HRD1Q08109 YGL262WYGL262W 528 nt2.81□□□□□ -1.96
HRD1Q08109 SPC42YKL042W 1092 nt2.81□□□□□ -1.96
HRD1Q08109 ECM4YKR076W 1113 nt2.81□□□□□ -1.96
HRD1Q08109 YMR141CYMR141C 309 nt2.81□□□□□ -1.96
HRD1Q08109 TPM1YNL079C 600 nt2.81□□□□□ -1.96
HRD1Q08109 MCK1YNL307C 1128 nt2.81□□□□□ -1.96
HRD1Q08109 ALG5YPL227C 1005 nt2.81□□□□□ -1.96
HRD1Q08109 LCB4YOR171C 1875 nt2.81□□□□□ -1.96
HRD1Q08109 TFC1YBR123C 1950 nt2.81□□□□□ -1.96
HRD1Q08109 YBR238CYBR238C 2196 nt2.81□□□□□ -1.96
HRD1Q08109 FLO1YAR050W 4614 nt2.81□□□□□ -1.96
HRD1Q08109 CHA4YLR098C 1947 nt2.8□□□□□ -1.96
HRD1Q08109 NDT80YHR124W 1884 nt2.8□□□□□ -1.96
HRD1Q08109 MIG1YGL035C 1515 nt2.8□□□□□ -1.96
HRD1Q08109 ARD1YHR013C 717 nt2.8□□□□□ -1.96
HRD1Q08109 COQ9YLR201C 783 nt2.8□□□□□ -1.96
HRD1Q08109 HMX1YLR205C 954 nt2.8□□□□□ -1.96
HRD1Q08109 RSF1YMR030W 1131 nt2.8□□□□□ -1.96
HRD1Q08109 DIB1YPR082C 432 nt2.8□□□□□ -1.96
HRD1Q08109 YBR300CYBR300C 498 nt2.8□□□□□ -1.96
HRD1Q08109 TIF4631YGR162W 2859 nt2.8□□□□□ -1.96
HRD1Q08109 MIT1YEL007W 2001 nt2.8□□□□□ -1.96
HRD1Q08109 EMP70YLR083C 2004 nt2.8□□□□□ -1.96
HRD1Q08109 DYN1YKR054C 12279 nt2.79□□□□□ -1.96
HRD1Q08109 TEC1YBR083W 1461 nt2.79□□□□□ -1.96
HRD1Q08109 REE1YJL217W 597 nt2.79□□□□□ -1.96
HRD1Q08109 RSA3YLR221C 663 nt2.79□□□□□ -1.96
HRD1Q08109 YIL082W-AYIL082W-A 4497 nt2.79□□□□□ -1.96
HRD1Q08109 MAL12YGR292W 1755 nt2.79□□□□□ -1.96
HRD1Q08109 MAL32YBR299W 1755 nt2.79□□□□□ -1.96
HRD1Q08109 XRN1YGL173C 4587 nt2.79□□□□□ -1.96
HRD1Q08109 CCT7YJL111W 1653 nt2.79□□□□□ -1.96
HRD1Q08109 TRM13YOL125W 1431 nt2.78□□□□□ -1.96
HRD1Q08109 JEN1YKL217W 1851 nt2.78□□□□□ -1.96
HRD1Q08109 MRPL25YGR076C 474 nt2.78□□□□□ -1.96
HRD1Q08109 PHD1YKL043W 1101 nt2.78□□□□□ -1.96
HRD1Q08109 RPS21AYKR057W 264 nt2.78□□□□□ -1.96
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