Protein–RNA interactions for Protein: Q06643

LTB, Lymphotoxin-beta, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBQ06643 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
LTBQ06643 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
LTBQ06643 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
LTBQ06643 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
LTBQ06643 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
LTBQ06643 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
LTBQ06643 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
LTBQ06643 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
LTBQ06643 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
LTBQ06643 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
LTBQ06643 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
LTBQ06643 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
LTBQ06643 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC19.72■□□□□ 0.75
LTBQ06643 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
LTBQ06643 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
LTBQ06643 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
LTBQ06643 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
LTBQ06643 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
LTBQ06643 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
LTBQ06643 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
LTBQ06643 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
LTBQ06643 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
LTBQ06643 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
LTBQ06643 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
LTBQ06643 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
LTBQ06643 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
LTBQ06643 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
LTBQ06643 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
LTBQ06643 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
LTBQ06643 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
LTBQ06643 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
LTBQ06643 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
LTBQ06643 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
LTBQ06643 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
LTBQ06643 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
LTBQ06643 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
LTBQ06643 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
LTBQ06643 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
LTBQ06643 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
LTBQ06643 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
LTBQ06643 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
LTBQ06643 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
LTBQ06643 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
LTBQ06643 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
LTBQ06643 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
LTBQ06643 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
LTBQ06643 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
LTBQ06643 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
LTBQ06643 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
LTBQ06643 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
LTBQ06643 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
LTBQ06643 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
LTBQ06643 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
LTBQ06643 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
LTBQ06643 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
LTBQ06643 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
LTBQ06643 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
LTBQ06643 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
LTBQ06643 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
LTBQ06643 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
LTBQ06643 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
LTBQ06643 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
LTBQ06643 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
LTBQ06643 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
LTBQ06643 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
LTBQ06643 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
LTBQ06643 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
LTBQ06643 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
LTBQ06643 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
LTBQ06643 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
LTBQ06643 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC19.69■□□□□ 0.74
LTBQ06643 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
LTBQ06643 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
LTBQ06643 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
LTBQ06643 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
LTBQ06643 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
LTBQ06643 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
LTBQ06643 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
LTBQ06643 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
LTBQ06643 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
LTBQ06643 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
LTBQ06643 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
LTBQ06643 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
LTBQ06643 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
LTBQ06643 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
LTBQ06643 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
LTBQ06643 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
LTBQ06643 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
LTBQ06643 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
LTBQ06643 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
LTBQ06643 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
LTBQ06643 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
LTBQ06643 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
LTBQ06643 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
LTBQ06643 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
LTBQ06643 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
LTBQ06643 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
LTBQ06643 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
LTBQ06643 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
LTBQ06643 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms