Protein–RNA interactions for Protein: Q06546

GABPA, GA-binding protein alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABPAQ06546 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
GABPAQ06546 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
GABPAQ06546 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
GABPAQ06546 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
GABPAQ06546 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
GABPAQ06546 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
GABPAQ06546 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
GABPAQ06546 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
GABPAQ06546 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
GABPAQ06546 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
GABPAQ06546 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
GABPAQ06546 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC25.58■■□□□ 1.69
GABPAQ06546 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
GABPAQ06546 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
GABPAQ06546 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
GABPAQ06546 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
GABPAQ06546 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
GABPAQ06546 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
GABPAQ06546 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
GABPAQ06546 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC25.57■■□□□ 1.68
GABPAQ06546 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
GABPAQ06546 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
GABPAQ06546 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
GABPAQ06546 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
GABPAQ06546 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
GABPAQ06546 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
GABPAQ06546 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
GABPAQ06546 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
GABPAQ06546 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
GABPAQ06546 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
GABPAQ06546 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
GABPAQ06546 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
GABPAQ06546 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
GABPAQ06546 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
GABPAQ06546 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
GABPAQ06546 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
GABPAQ06546 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
GABPAQ06546 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
GABPAQ06546 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
GABPAQ06546 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
GABPAQ06546 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
GABPAQ06546 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
GABPAQ06546 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
GABPAQ06546 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
GABPAQ06546 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
GABPAQ06546 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
GABPAQ06546 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
GABPAQ06546 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
GABPAQ06546 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
GABPAQ06546 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
GABPAQ06546 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
GABPAQ06546 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
GABPAQ06546 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
GABPAQ06546 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
GABPAQ06546 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
GABPAQ06546 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
GABPAQ06546 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
GABPAQ06546 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
GABPAQ06546 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
GABPAQ06546 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
GABPAQ06546 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
GABPAQ06546 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
GABPAQ06546 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
GABPAQ06546 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
GABPAQ06546 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
GABPAQ06546 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
GABPAQ06546 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
GABPAQ06546 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
GABPAQ06546 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
GABPAQ06546 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
GABPAQ06546 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
GABPAQ06546 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
GABPAQ06546 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
GABPAQ06546 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
GABPAQ06546 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC25.52■■□□□ 1.68
GABPAQ06546 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
GABPAQ06546 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
GABPAQ06546 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
GABPAQ06546 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
GABPAQ06546 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
GABPAQ06546 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
GABPAQ06546 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
GABPAQ06546 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
GABPAQ06546 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
GABPAQ06546 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
GABPAQ06546 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
GABPAQ06546 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
GABPAQ06546 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
GABPAQ06546 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
GABPAQ06546 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
GABPAQ06546 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
GABPAQ06546 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
GABPAQ06546 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
GABPAQ06546 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
GABPAQ06546 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
GABPAQ06546 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
GABPAQ06546 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
GABPAQ06546 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
GABPAQ06546 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
GABPAQ06546 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.4 ms