Protein–RNA interactions for Protein: Q03169

TNFAIP2, Tumor necrosis factor alpha-induced protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 654 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFAIP2Q03169 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TNFAIP2Q03169 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TNFAIP2Q03169 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
TNFAIP2Q03169 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TNFAIP2Q03169 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TNFAIP2Q03169 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TNFAIP2Q03169 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
TNFAIP2Q03169 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TNFAIP2Q03169 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TNFAIP2Q03169 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TNFAIP2Q03169 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TNFAIP2Q03169 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TNFAIP2Q03169 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TNFAIP2Q03169 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TNFAIP2Q03169 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TNFAIP2Q03169 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
TNFAIP2Q03169 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TNFAIP2Q03169 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TNFAIP2Q03169 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TNFAIP2Q03169 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TNFAIP2Q03169 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TNFAIP2Q03169 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TNFAIP2Q03169 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TNFAIP2Q03169 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TNFAIP2Q03169 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
TNFAIP2Q03169 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TNFAIP2Q03169 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TNFAIP2Q03169 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
TNFAIP2Q03169 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
TNFAIP2Q03169 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TNFAIP2Q03169 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TNFAIP2Q03169 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TNFAIP2Q03169 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TNFAIP2Q03169 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TNFAIP2Q03169 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TNFAIP2Q03169 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TNFAIP2Q03169 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TNFAIP2Q03169 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TNFAIP2Q03169 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TNFAIP2Q03169 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TNFAIP2Q03169 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TNFAIP2Q03169 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TNFAIP2Q03169 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TNFAIP2Q03169 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TNFAIP2Q03169 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TNFAIP2Q03169 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TNFAIP2Q03169 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TNFAIP2Q03169 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TNFAIP2Q03169 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TNFAIP2Q03169 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TNFAIP2Q03169 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TNFAIP2Q03169 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TNFAIP2Q03169 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TNFAIP2Q03169 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TNFAIP2Q03169 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TNFAIP2Q03169 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TNFAIP2Q03169 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TNFAIP2Q03169 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TNFAIP2Q03169 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TNFAIP2Q03169 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TNFAIP2Q03169 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TNFAIP2Q03169 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TNFAIP2Q03169 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TNFAIP2Q03169 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TNFAIP2Q03169 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
TNFAIP2Q03169 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TNFAIP2Q03169 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TNFAIP2Q03169 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TNFAIP2Q03169 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TNFAIP2Q03169 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TNFAIP2Q03169 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TNFAIP2Q03169 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TNFAIP2Q03169 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TNFAIP2Q03169 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TNFAIP2Q03169 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TNFAIP2Q03169 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TNFAIP2Q03169 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TNFAIP2Q03169 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TNFAIP2Q03169 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TNFAIP2Q03169 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TNFAIP2Q03169 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TNFAIP2Q03169 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TNFAIP2Q03169 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TNFAIP2Q03169 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TNFAIP2Q03169 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TNFAIP2Q03169 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TNFAIP2Q03169 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
TNFAIP2Q03169 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TNFAIP2Q03169 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TNFAIP2Q03169 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TNFAIP2Q03169 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TNFAIP2Q03169 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TNFAIP2Q03169 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TNFAIP2Q03169 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TNFAIP2Q03169 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TNFAIP2Q03169 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TNFAIP2Q03169 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
TNFAIP2Q03169 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TNFAIP2Q03169 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TNFAIP2Q03169 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.4 ms