Protein–RNA interactions for Protein: Q01892

SPIB, Transcription factor Spi-B, humanhuman

Predictions only

Length 262 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIBQ01892 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SPIBQ01892 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SPIBQ01892 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SPIBQ01892 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
SPIBQ01892 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SPIBQ01892 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SPIBQ01892 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SPIBQ01892 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SPIBQ01892 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SPIBQ01892 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SPIBQ01892 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SPIBQ01892 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
SPIBQ01892 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SPIBQ01892 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SPIBQ01892 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SPIBQ01892 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SPIBQ01892 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SPIBQ01892 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SPIBQ01892 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SPIBQ01892 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SPIBQ01892 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SPIBQ01892 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SPIBQ01892 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SPIBQ01892 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SPIBQ01892 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SPIBQ01892 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SPIBQ01892 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SPIBQ01892 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SPIBQ01892 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SPIBQ01892 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SPIBQ01892 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SPIBQ01892 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SPIBQ01892 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
SPIBQ01892 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SPIBQ01892 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SPIBQ01892 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SPIBQ01892 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SPIBQ01892 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SPIBQ01892 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SPIBQ01892 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SPIBQ01892 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SPIBQ01892 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SPIBQ01892 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SPIBQ01892 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
SPIBQ01892 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SPIBQ01892 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SPIBQ01892 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SPIBQ01892 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SPIBQ01892 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SPIBQ01892 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SPIBQ01892 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SPIBQ01892 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SPIBQ01892 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SPIBQ01892 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SPIBQ01892 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SPIBQ01892 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SPIBQ01892 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SPIBQ01892 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SPIBQ01892 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SPIBQ01892 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SPIBQ01892 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SPIBQ01892 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SPIBQ01892 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SPIBQ01892 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SPIBQ01892 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SPIBQ01892 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SPIBQ01892 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SPIBQ01892 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SPIBQ01892 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SPIBQ01892 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SPIBQ01892 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
SPIBQ01892 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SPIBQ01892 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SPIBQ01892 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SPIBQ01892 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SPIBQ01892 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SPIBQ01892 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SPIBQ01892 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SPIBQ01892 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SPIBQ01892 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SPIBQ01892 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SPIBQ01892 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SPIBQ01892 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SPIBQ01892 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
SPIBQ01892 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
SPIBQ01892 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
SPIBQ01892 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
SPIBQ01892 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
SPIBQ01892 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
SPIBQ01892 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SPIBQ01892 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SPIBQ01892 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SPIBQ01892 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SPIBQ01892 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SPIBQ01892 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SPIBQ01892 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SPIBQ01892 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SPIBQ01892 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SPIBQ01892 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SPIBQ01892 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms