Protein–RNA interactions for Protein: Q00526

CDK3, Cyclin-dependent kinase 3, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK3Q00526 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDK3Q00526 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDK3Q00526 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDK3Q00526 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDK3Q00526 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CDK3Q00526 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
CDK3Q00526 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CDK3Q00526 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CDK3Q00526 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CDK3Q00526 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CDK3Q00526 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CDK3Q00526 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CDK3Q00526 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CDK3Q00526 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CDK3Q00526 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CDK3Q00526 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CDK3Q00526 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CDK3Q00526 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CDK3Q00526 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CDK3Q00526 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CDK3Q00526 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CDK3Q00526 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CDK3Q00526 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDK3Q00526 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDK3Q00526 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDK3Q00526 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDK3Q00526 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDK3Q00526 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDK3Q00526 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDK3Q00526 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDK3Q00526 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDK3Q00526 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CDK3Q00526 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDK3Q00526 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDK3Q00526 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDK3Q00526 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDK3Q00526 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDK3Q00526 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDK3Q00526 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDK3Q00526 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDK3Q00526 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDK3Q00526 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDK3Q00526 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDK3Q00526 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDK3Q00526 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDK3Q00526 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDK3Q00526 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDK3Q00526 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDK3Q00526 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDK3Q00526 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDK3Q00526 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDK3Q00526 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDK3Q00526 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDK3Q00526 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDK3Q00526 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDK3Q00526 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDK3Q00526 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDK3Q00526 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDK3Q00526 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDK3Q00526 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDK3Q00526 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDK3Q00526 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDK3Q00526 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CDK3Q00526 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDK3Q00526 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDK3Q00526 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDK3Q00526 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDK3Q00526 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDK3Q00526 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CDK3Q00526 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDK3Q00526 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDK3Q00526 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CDK3Q00526 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDK3Q00526 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDK3Q00526 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDK3Q00526 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CDK3Q00526 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDK3Q00526 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDK3Q00526 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDK3Q00526 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDK3Q00526 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDK3Q00526 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDK3Q00526 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDK3Q00526 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDK3Q00526 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDK3Q00526 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDK3Q00526 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDK3Q00526 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDK3Q00526 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDK3Q00526 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDK3Q00526 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDK3Q00526 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDK3Q00526 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CDK3Q00526 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CDK3Q00526 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CDK3Q00526 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CDK3Q00526 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CDK3Q00526 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CDK3Q00526 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CDK3Q00526 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms