Protein–RNA interactions for Protein: Q00266

MAT1A, S-adenosylmethionine synthase isoform type-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAT1AQ00266 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
MAT1AQ00266 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
MAT1AQ00266 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
MAT1AQ00266 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
MAT1AQ00266 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
MAT1AQ00266 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
MAT1AQ00266 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
MAT1AQ00266 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
MAT1AQ00266 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
MAT1AQ00266 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
MAT1AQ00266 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
MAT1AQ00266 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
MAT1AQ00266 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
MAT1AQ00266 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
MAT1AQ00266 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
MAT1AQ00266 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
MAT1AQ00266 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
MAT1AQ00266 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
MAT1AQ00266 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
MAT1AQ00266 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
MAT1AQ00266 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC20.5■□□□□ 0.87
MAT1AQ00266 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
MAT1AQ00266 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
MAT1AQ00266 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
MAT1AQ00266 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MAT1AQ00266 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MAT1AQ00266 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MAT1AQ00266 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
MAT1AQ00266 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MAT1AQ00266 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
MAT1AQ00266 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MAT1AQ00266 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
MAT1AQ00266 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
MAT1AQ00266 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MAT1AQ00266 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MAT1AQ00266 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MAT1AQ00266 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
MAT1AQ00266 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MAT1AQ00266 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
MAT1AQ00266 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
MAT1AQ00266 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MAT1AQ00266 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MAT1AQ00266 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MAT1AQ00266 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MAT1AQ00266 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MAT1AQ00266 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MAT1AQ00266 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MAT1AQ00266 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
MAT1AQ00266 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
MAT1AQ00266 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
MAT1AQ00266 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MAT1AQ00266 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MAT1AQ00266 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
MAT1AQ00266 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MAT1AQ00266 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MAT1AQ00266 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
MAT1AQ00266 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
MAT1AQ00266 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
MAT1AQ00266 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
MAT1AQ00266 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MAT1AQ00266 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MAT1AQ00266 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
MAT1AQ00266 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
MAT1AQ00266 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
MAT1AQ00266 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
MAT1AQ00266 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
MAT1AQ00266 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MAT1AQ00266 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MAT1AQ00266 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
MAT1AQ00266 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MAT1AQ00266 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MAT1AQ00266 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
MAT1AQ00266 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
MAT1AQ00266 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
MAT1AQ00266 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
MAT1AQ00266 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MAT1AQ00266 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MAT1AQ00266 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
MAT1AQ00266 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
MAT1AQ00266 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
MAT1AQ00266 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
MAT1AQ00266 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
MAT1AQ00266 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
MAT1AQ00266 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
MAT1AQ00266 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
MAT1AQ00266 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
MAT1AQ00266 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
MAT1AQ00266 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
MAT1AQ00266 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
MAT1AQ00266 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
MAT1AQ00266 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
MAT1AQ00266 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC20.45■□□□□ 0.86
MAT1AQ00266 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
MAT1AQ00266 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
MAT1AQ00266 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
MAT1AQ00266 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
MAT1AQ00266 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
MAT1AQ00266 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
MAT1AQ00266 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
MAT1AQ00266 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms