Protein–RNA interactions for Protein: P82279

CRB1, Protein crumbs homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRB1P82279 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CRB1P82279 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CRB1P82279 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CRB1P82279 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CRB1P82279 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
CRB1P82279 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CRB1P82279 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
CRB1P82279 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
CRB1P82279 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
CRB1P82279 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CRB1P82279 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
CRB1P82279 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
CRB1P82279 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CRB1P82279 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
CRB1P82279 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CRB1P82279 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CRB1P82279 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CRB1P82279 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
CRB1P82279 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
CRB1P82279 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CRB1P82279 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CRB1P82279 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
CRB1P82279 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
CRB1P82279 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
CRB1P82279 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CRB1P82279 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
CRB1P82279 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
CRB1P82279 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
CRB1P82279 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
CRB1P82279 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CRB1P82279 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CRB1P82279 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
CRB1P82279 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
CRB1P82279 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
CRB1P82279 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
CRB1P82279 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CRB1P82279 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
CRB1P82279 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
CRB1P82279 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
CRB1P82279 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
CRB1P82279 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CRB1P82279 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CRB1P82279 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CRB1P82279 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CRB1P82279 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CRB1P82279 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CRB1P82279 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CRB1P82279 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CRB1P82279 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
CRB1P82279 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CRB1P82279 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CRB1P82279 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
CRB1P82279 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
CRB1P82279 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CRB1P82279 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.07■■■□□ 2.24
CRB1P82279 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CRB1P82279 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CRB1P82279 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
CRB1P82279 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CRB1P82279 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CRB1P82279 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CRB1P82279 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CRB1P82279 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
CRB1P82279 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CRB1P82279 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CRB1P82279 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CRB1P82279 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CRB1P82279 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CRB1P82279 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CRB1P82279 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CRB1P82279 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CRB1P82279 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CRB1P82279 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CRB1P82279 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CRB1P82279 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
CRB1P82279 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CRB1P82279 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CRB1P82279 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CRB1P82279 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CRB1P82279 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CRB1P82279 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CRB1P82279 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CRB1P82279 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CRB1P82279 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
CRB1P82279 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CRB1P82279 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CRB1P82279 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CRB1P82279 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CRB1P82279 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CRB1P82279 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CRB1P82279 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CRB1P82279 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CRB1P82279 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CRB1P82279 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CRB1P82279 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CRB1P82279 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CRB1P82279 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CRB1P82279 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CRB1P82279 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
CRB1P82279 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.1 ms