Protein–RNA interactions for Protein: P63132

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Pol protein, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P63132 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
HERVK_113P63132 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
HERVK_113P63132 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
HERVK_113P63132 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
HERVK_113P63132 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
HERVK_113P63132 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC21.18■□□□□ 0.98
HERVK_113P63132 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
HERVK_113P63132 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
HERVK_113P63132 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
HERVK_113P63132 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
HERVK_113P63132 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
HERVK_113P63132 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
HERVK_113P63132 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
HERVK_113P63132 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
HERVK_113P63132 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
HERVK_113P63132 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
HERVK_113P63132 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
HERVK_113P63132 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
HERVK_113P63132 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
HERVK_113P63132 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
HERVK_113P63132 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
HERVK_113P63132 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
HERVK_113P63132 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
HERVK_113P63132 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
HERVK_113P63132 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
HERVK_113P63132 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
HERVK_113P63132 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
HERVK_113P63132 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
HERVK_113P63132 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
HERVK_113P63132 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
HERVK_113P63132 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
HERVK_113P63132 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
HERVK_113P63132 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
HERVK_113P63132 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
HERVK_113P63132 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
HERVK_113P63132 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
HERVK_113P63132 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
HERVK_113P63132 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
HERVK_113P63132 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
HERVK_113P63132 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
HERVK_113P63132 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
HERVK_113P63132 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
HERVK_113P63132 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
HERVK_113P63132 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
HERVK_113P63132 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
HERVK_113P63132 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
HERVK_113P63132 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
HERVK_113P63132 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
HERVK_113P63132 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
HERVK_113P63132 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
HERVK_113P63132 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
HERVK_113P63132 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
HERVK_113P63132 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
HERVK_113P63132 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
HERVK_113P63132 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
HERVK_113P63132 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
HERVK_113P63132 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
HERVK_113P63132 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
HERVK_113P63132 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
HERVK_113P63132 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
HERVK_113P63132 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
HERVK_113P63132 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
HERVK_113P63132 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
HERVK_113P63132 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
HERVK_113P63132 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
HERVK_113P63132 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
HERVK_113P63132 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
HERVK_113P63132 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
HERVK_113P63132 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
HERVK_113P63132 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
HERVK_113P63132 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
HERVK_113P63132 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
HERVK_113P63132 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
HERVK_113P63132 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
HERVK_113P63132 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
HERVK_113P63132 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HERVK_113P63132 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HERVK_113P63132 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HERVK_113P63132 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
HERVK_113P63132 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
HERVK_113P63132 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
HERVK_113P63132 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
HERVK_113P63132 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HERVK_113P63132 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
HERVK_113P63132 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HERVK_113P63132 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
HERVK_113P63132 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HERVK_113P63132 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HERVK_113P63132 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HERVK_113P63132 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
HERVK_113P63132 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HERVK_113P63132 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HERVK_113P63132 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
HERVK_113P63132 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
HERVK_113P63132 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HERVK_113P63132 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HERVK_113P63132 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HERVK_113P63132 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HERVK_113P63132 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HERVK_113P63132 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms