Protein–RNA interactions for Protein: P62330

ARF6, ADP-ribosylation factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 175 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARF6P62330 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ARF6P62330 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ARF6P62330 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ARF6P62330 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ARF6P62330 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ARF6P62330 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
ARF6P62330 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
ARF6P62330 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ARF6P62330 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ARF6P62330 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ARF6P62330 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ARF6P62330 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ARF6P62330 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ARF6P62330 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ARF6P62330 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ARF6P62330 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ARF6P62330 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ARF6P62330 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ARF6P62330 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ARF6P62330 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ARF6P62330 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ARF6P62330 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
ARF6P62330 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ARF6P62330 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ARF6P62330 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ARF6P62330 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ARF6P62330 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ARF6P62330 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ARF6P62330 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ARF6P62330 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ARF6P62330 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ARF6P62330 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ARF6P62330 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ARF6P62330 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ARF6P62330 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ARF6P62330 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ARF6P62330 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ARF6P62330 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ARF6P62330 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ARF6P62330 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ARF6P62330 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
ARF6P62330 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ARF6P62330 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ARF6P62330 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ARF6P62330 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
ARF6P62330 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ARF6P62330 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ARF6P62330 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ARF6P62330 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ARF6P62330 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ARF6P62330 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ARF6P62330 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ARF6P62330 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ARF6P62330 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ARF6P62330 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ARF6P62330 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ARF6P62330 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ARF6P62330 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ARF6P62330 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ARF6P62330 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ARF6P62330 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ARF6P62330 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
ARF6P62330 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ARF6P62330 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ARF6P62330 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ARF6P62330 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ARF6P62330 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ARF6P62330 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ARF6P62330 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ARF6P62330 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ARF6P62330 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ARF6P62330 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ARF6P62330 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ARF6P62330 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ARF6P62330 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ARF6P62330 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
ARF6P62330 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ARF6P62330 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ARF6P62330 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ARF6P62330 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
ARF6P62330 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ARF6P62330 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ARF6P62330 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ARF6P62330 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ARF6P62330 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ARF6P62330 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ARF6P62330 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ARF6P62330 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ARF6P62330 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ARF6P62330 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ARF6P62330 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ARF6P62330 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ARF6P62330 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ARF6P62330 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ARF6P62330 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ARF6P62330 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ARF6P62330 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ARF6P62330 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ARF6P62330 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ARF6P62330 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms