Protein–RNA interactions for Protein: P61923

COPZ1, Coatomer subunit zeta-1, humanhuman

Predictions only

Length 177 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPZ1P61923 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
COPZ1P61923 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
COPZ1P61923 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
COPZ1P61923 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
COPZ1P61923 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
COPZ1P61923 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
COPZ1P61923 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
COPZ1P61923 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
COPZ1P61923 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
COPZ1P61923 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
COPZ1P61923 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
COPZ1P61923 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
COPZ1P61923 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
COPZ1P61923 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
COPZ1P61923 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
COPZ1P61923 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
COPZ1P61923 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
COPZ1P61923 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
COPZ1P61923 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
COPZ1P61923 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
COPZ1P61923 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
COPZ1P61923 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
COPZ1P61923 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
COPZ1P61923 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
COPZ1P61923 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
COPZ1P61923 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
COPZ1P61923 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
COPZ1P61923 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
COPZ1P61923 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
COPZ1P61923 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
COPZ1P61923 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
COPZ1P61923 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
COPZ1P61923 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
COPZ1P61923 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
COPZ1P61923 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
COPZ1P61923 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
COPZ1P61923 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
COPZ1P61923 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
COPZ1P61923 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
COPZ1P61923 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
COPZ1P61923 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
COPZ1P61923 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
COPZ1P61923 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
COPZ1P61923 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
COPZ1P61923 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
COPZ1P61923 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
COPZ1P61923 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
COPZ1P61923 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
COPZ1P61923 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
COPZ1P61923 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
COPZ1P61923 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
COPZ1P61923 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
COPZ1P61923 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
COPZ1P61923 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
COPZ1P61923 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
COPZ1P61923 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
COPZ1P61923 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
COPZ1P61923 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
COPZ1P61923 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
COPZ1P61923 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
COPZ1P61923 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
COPZ1P61923 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
COPZ1P61923 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
COPZ1P61923 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
COPZ1P61923 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
COPZ1P61923 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
COPZ1P61923 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
COPZ1P61923 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
COPZ1P61923 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
COPZ1P61923 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
COPZ1P61923 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
COPZ1P61923 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
COPZ1P61923 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
COPZ1P61923 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
COPZ1P61923 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
COPZ1P61923 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
COPZ1P61923 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
COPZ1P61923 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
COPZ1P61923 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
COPZ1P61923 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
COPZ1P61923 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
COPZ1P61923 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
COPZ1P61923 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
COPZ1P61923 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
COPZ1P61923 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
COPZ1P61923 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
COPZ1P61923 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
COPZ1P61923 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
COPZ1P61923 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
COPZ1P61923 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
COPZ1P61923 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
COPZ1P61923 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
COPZ1P61923 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
COPZ1P61923 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
COPZ1P61923 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
COPZ1P61923 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
COPZ1P61923 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
COPZ1P61923 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
COPZ1P61923 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
COPZ1P61923 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms