Protein–RNA interactions for Protein: P57682

KLF3, Krueppel-like factor 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 345 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF3P57682 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
KLF3P57682 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
KLF3P57682 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
KLF3P57682 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
KLF3P57682 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
KLF3P57682 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
KLF3P57682 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
KLF3P57682 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
KLF3P57682 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
KLF3P57682 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
KLF3P57682 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
KLF3P57682 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
KLF3P57682 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
KLF3P57682 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
KLF3P57682 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
KLF3P57682 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
KLF3P57682 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
KLF3P57682 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
KLF3P57682 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
KLF3P57682 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
KLF3P57682 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
KLF3P57682 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
KLF3P57682 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
KLF3P57682 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
KLF3P57682 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
KLF3P57682 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
KLF3P57682 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
KLF3P57682 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
KLF3P57682 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
KLF3P57682 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
KLF3P57682 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
KLF3P57682 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
KLF3P57682 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
KLF3P57682 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
KLF3P57682 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
KLF3P57682 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
KLF3P57682 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
KLF3P57682 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
KLF3P57682 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
KLF3P57682 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
KLF3P57682 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
KLF3P57682 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
KLF3P57682 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
KLF3P57682 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
KLF3P57682 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
KLF3P57682 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
KLF3P57682 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
KLF3P57682 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
KLF3P57682 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
KLF3P57682 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
KLF3P57682 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
KLF3P57682 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
KLF3P57682 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
KLF3P57682 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
KLF3P57682 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
KLF3P57682 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
KLF3P57682 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
KLF3P57682 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
KLF3P57682 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
KLF3P57682 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
KLF3P57682 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
KLF3P57682 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
KLF3P57682 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
KLF3P57682 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
KLF3P57682 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC18.55■□□□□ 0.56
KLF3P57682 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.55■□□□□ 0.56
KLF3P57682 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
KLF3P57682 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
KLF3P57682 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
KLF3P57682 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
KLF3P57682 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
KLF3P57682 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
KLF3P57682 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
KLF3P57682 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
KLF3P57682 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
KLF3P57682 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
KLF3P57682 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
KLF3P57682 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
KLF3P57682 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
KLF3P57682 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
KLF3P57682 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
KLF3P57682 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
KLF3P57682 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
KLF3P57682 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
KLF3P57682 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
KLF3P57682 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
KLF3P57682 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
KLF3P57682 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
KLF3P57682 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
KLF3P57682 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
KLF3P57682 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
KLF3P57682 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
KLF3P57682 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
KLF3P57682 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
KLF3P57682 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
KLF3P57682 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
KLF3P57682 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
KLF3P57682 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
KLF3P57682 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
KLF3P57682 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms