Protein–RNA interactions for Protein: P56377

AP1S2, AP-1 complex subunit sigma-2, humanhuman

Predictions only

Length 157 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP1S2P56377 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
AP1S2P56377 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.12■□□□□ 0.97
AP1S2P56377 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
AP1S2P56377 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
AP1S2P56377 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
AP1S2P56377 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
AP1S2P56377 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
AP1S2P56377 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
AP1S2P56377 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
AP1S2P56377 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
AP1S2P56377 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
AP1S2P56377 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
AP1S2P56377 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
AP1S2P56377 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
AP1S2P56377 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
AP1S2P56377 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
AP1S2P56377 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
AP1S2P56377 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
AP1S2P56377 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
AP1S2P56377 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
AP1S2P56377 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
AP1S2P56377 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
AP1S2P56377 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
AP1S2P56377 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
AP1S2P56377 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
AP1S2P56377 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
AP1S2P56377 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
AP1S2P56377 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
AP1S2P56377 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
AP1S2P56377 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
AP1S2P56377 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
AP1S2P56377 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
AP1S2P56377 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
AP1S2P56377 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
AP1S2P56377 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
AP1S2P56377 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
AP1S2P56377 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
AP1S2P56377 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
AP1S2P56377 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
AP1S2P56377 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
AP1S2P56377 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
AP1S2P56377 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
AP1S2P56377 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
AP1S2P56377 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
AP1S2P56377 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
AP1S2P56377 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
AP1S2P56377 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
AP1S2P56377 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
AP1S2P56377 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
AP1S2P56377 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
AP1S2P56377 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
AP1S2P56377 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
AP1S2P56377 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
AP1S2P56377 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
AP1S2P56377 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
AP1S2P56377 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
AP1S2P56377 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
AP1S2P56377 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
AP1S2P56377 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
AP1S2P56377 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
AP1S2P56377 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
AP1S2P56377 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
AP1S2P56377 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
AP1S2P56377 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
AP1S2P56377 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
AP1S2P56377 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
AP1S2P56377 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
AP1S2P56377 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
AP1S2P56377 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
AP1S2P56377 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.07■□□□□ 0.96
AP1S2P56377 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
AP1S2P56377 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
AP1S2P56377 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
AP1S2P56377 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
AP1S2P56377 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
AP1S2P56377 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
AP1S2P56377 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
AP1S2P56377 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
AP1S2P56377 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
AP1S2P56377 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
AP1S2P56377 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
AP1S2P56377 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
AP1S2P56377 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
AP1S2P56377 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
AP1S2P56377 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
AP1S2P56377 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
AP1S2P56377 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
AP1S2P56377 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
AP1S2P56377 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
AP1S2P56377 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
AP1S2P56377 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
AP1S2P56377 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
AP1S2P56377 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
AP1S2P56377 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
AP1S2P56377 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
AP1S2P56377 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
AP1S2P56377 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
AP1S2P56377 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
AP1S2P56377 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
AP1S2P56377 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms