Protein–RNA interactions for Protein: P55809

OXCT1, Succinyl-CoA:3-ketoacid coenzyme A transferase 1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OXCT1P55809 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
OXCT1P55809 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
OXCT1P55809 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
OXCT1P55809 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
OXCT1P55809 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
OXCT1P55809 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
OXCT1P55809 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
OXCT1P55809 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
OXCT1P55809 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
OXCT1P55809 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
OXCT1P55809 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
OXCT1P55809 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
OXCT1P55809 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
OXCT1P55809 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
OXCT1P55809 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
OXCT1P55809 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
OXCT1P55809 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
OXCT1P55809 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
OXCT1P55809 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
OXCT1P55809 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
OXCT1P55809 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
OXCT1P55809 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
OXCT1P55809 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
OXCT1P55809 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
OXCT1P55809 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
OXCT1P55809 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
OXCT1P55809 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
OXCT1P55809 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
OXCT1P55809 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
OXCT1P55809 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
OXCT1P55809 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
OXCT1P55809 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
OXCT1P55809 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
OXCT1P55809 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
OXCT1P55809 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
OXCT1P55809 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
OXCT1P55809 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
OXCT1P55809 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
OXCT1P55809 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
OXCT1P55809 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
OXCT1P55809 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
OXCT1P55809 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
OXCT1P55809 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
OXCT1P55809 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
OXCT1P55809 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
OXCT1P55809 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
OXCT1P55809 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
OXCT1P55809 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
OXCT1P55809 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
OXCT1P55809 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
OXCT1P55809 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
OXCT1P55809 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
OXCT1P55809 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
OXCT1P55809 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
OXCT1P55809 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
OXCT1P55809 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
OXCT1P55809 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
OXCT1P55809 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
OXCT1P55809 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
OXCT1P55809 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
OXCT1P55809 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
OXCT1P55809 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
OXCT1P55809 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
OXCT1P55809 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
OXCT1P55809 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
OXCT1P55809 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
OXCT1P55809 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
OXCT1P55809 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
OXCT1P55809 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
OXCT1P55809 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
OXCT1P55809 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
OXCT1P55809 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
OXCT1P55809 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
OXCT1P55809 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
OXCT1P55809 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
OXCT1P55809 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
OXCT1P55809 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
OXCT1P55809 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
OXCT1P55809 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
OXCT1P55809 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
OXCT1P55809 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
OXCT1P55809 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
OXCT1P55809 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
OXCT1P55809 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
OXCT1P55809 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
OXCT1P55809 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
OXCT1P55809 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
OXCT1P55809 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
OXCT1P55809 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
OXCT1P55809 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
OXCT1P55809 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
OXCT1P55809 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
OXCT1P55809 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
OXCT1P55809 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
OXCT1P55809 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
OXCT1P55809 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
OXCT1P55809 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
OXCT1P55809 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
OXCT1P55809 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
OXCT1P55809 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms