Protein–RNA interactions for Protein: P55773

CCL23, C-C motif chemokine 23, humanhuman

Predictions only

Length 120 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL23P55773 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCL23P55773 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCL23P55773 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCL23P55773 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCL23P55773 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCL23P55773 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCL23P55773 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCL23P55773 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCL23P55773 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCL23P55773 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCL23P55773 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
CCL23P55773 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCL23P55773 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCL23P55773 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCL23P55773 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCL23P55773 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCL23P55773 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
CCL23P55773 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCL23P55773 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCL23P55773 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCL23P55773 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCL23P55773 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCL23P55773 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCL23P55773 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
CCL23P55773 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCL23P55773 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCL23P55773 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCL23P55773 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCL23P55773 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCL23P55773 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCL23P55773 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCL23P55773 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
CCL23P55773 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCL23P55773 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCL23P55773 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCL23P55773 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCL23P55773 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
CCL23P55773 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCL23P55773 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCL23P55773 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCL23P55773 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCL23P55773 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCL23P55773 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCL23P55773 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCL23P55773 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCL23P55773 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCL23P55773 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCL23P55773 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCL23P55773 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCL23P55773 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCL23P55773 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCL23P55773 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCL23P55773 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCL23P55773 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCL23P55773 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCL23P55773 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
CCL23P55773 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCL23P55773 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCL23P55773 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCL23P55773 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCL23P55773 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCL23P55773 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
CCL23P55773 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCL23P55773 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCL23P55773 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCL23P55773 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCL23P55773 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCL23P55773 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCL23P55773 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCL23P55773 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCL23P55773 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
CCL23P55773 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCL23P55773 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCL23P55773 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCL23P55773 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCL23P55773 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCL23P55773 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
CCL23P55773 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCL23P55773 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCL23P55773 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCL23P55773 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCL23P55773 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCL23P55773 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCL23P55773 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCL23P55773 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
CCL23P55773 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCL23P55773 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCL23P55773 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCL23P55773 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCL23P55773 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
CCL23P55773 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCL23P55773 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCL23P55773 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
CCL23P55773 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCL23P55773 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCL23P55773 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCL23P55773 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCL23P55773 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCL23P55773 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCL23P55773 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.7 ms