Protein–RNA interactions for Protein: P53794

SLC5A3, Sodium/myo-inositol cotransporter, humanhuman

Predictions only

Length 718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC5A3P53794 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC5A3P53794 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC5A3P53794 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC5A3P53794 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC5A3P53794 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC5A3P53794 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC5A3P53794 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC5A3P53794 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC5A3P53794 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC5A3P53794 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC5A3P53794 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC5A3P53794 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC5A3P53794 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC5A3P53794 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC5A3P53794 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC5A3P53794 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC5A3P53794 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC5A3P53794 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC5A3P53794 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC5A3P53794 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC5A3P53794 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC5A3P53794 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC5A3P53794 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC5A3P53794 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC5A3P53794 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC5A3P53794 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC5A3P53794 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC5A3P53794 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC5A3P53794 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC5A3P53794 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC5A3P53794 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC5A3P53794 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC5A3P53794 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
SLC5A3P53794 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
SLC5A3P53794 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC5A3P53794 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC5A3P53794 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC5A3P53794 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC5A3P53794 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC5A3P53794 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC5A3P53794 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC5A3P53794 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC5A3P53794 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC5A3P53794 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC5A3P53794 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC5A3P53794 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC5A3P53794 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC5A3P53794 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC5A3P53794 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC5A3P53794 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC5A3P53794 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC5A3P53794 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC5A3P53794 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC5A3P53794 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC5A3P53794 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC5A3P53794 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC5A3P53794 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC5A3P53794 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC5A3P53794 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC5A3P53794 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC5A3P53794 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC5A3P53794 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC5A3P53794 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC5A3P53794 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC5A3P53794 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC5A3P53794 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC5A3P53794 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC5A3P53794 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC5A3P53794 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC5A3P53794 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC5A3P53794 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC5A3P53794 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC5A3P53794 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC5A3P53794 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC5A3P53794 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC5A3P53794 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC5A3P53794 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC5A3P53794 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC5A3P53794 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC5A3P53794 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC5A3P53794 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC5A3P53794 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC5A3P53794 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC5A3P53794 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC5A3P53794 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC5A3P53794 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC5A3P53794 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC5A3P53794 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC5A3P53794 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC5A3P53794 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC5A3P53794 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC5A3P53794 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC5A3P53794 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC5A3P53794 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC5A3P53794 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC5A3P53794 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC5A3P53794 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC5A3P53794 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC5A3P53794 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC5A3P53794 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms