Protein–RNA interactions for Protein: P53621

COPA, Coatomer subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPAP53621 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
COPAP53621 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
COPAP53621 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
COPAP53621 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
COPAP53621 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
COPAP53621 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
COPAP53621 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
COPAP53621 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
COPAP53621 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
COPAP53621 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
COPAP53621 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
COPAP53621 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
COPAP53621 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
COPAP53621 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
COPAP53621 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
COPAP53621 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
COPAP53621 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
COPAP53621 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
COPAP53621 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
COPAP53621 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
COPAP53621 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
COPAP53621 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
COPAP53621 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
COPAP53621 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
COPAP53621 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
COPAP53621 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
COPAP53621 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
COPAP53621 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
COPAP53621 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
COPAP53621 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
COPAP53621 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
COPAP53621 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
COPAP53621 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
COPAP53621 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
COPAP53621 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
COPAP53621 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
COPAP53621 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
COPAP53621 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
COPAP53621 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
COPAP53621 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
COPAP53621 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
COPAP53621 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
COPAP53621 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
COPAP53621 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
COPAP53621 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
COPAP53621 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
COPAP53621 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
COPAP53621 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
COPAP53621 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
COPAP53621 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
COPAP53621 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
COPAP53621 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
COPAP53621 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
COPAP53621 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
COPAP53621 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
COPAP53621 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
COPAP53621 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
COPAP53621 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
COPAP53621 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
COPAP53621 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
COPAP53621 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
COPAP53621 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
COPAP53621 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
COPAP53621 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
COPAP53621 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
COPAP53621 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
COPAP53621 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
COPAP53621 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
COPAP53621 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
COPAP53621 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
COPAP53621 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
COPAP53621 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
COPAP53621 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
COPAP53621 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
COPAP53621 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
COPAP53621 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
COPAP53621 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
COPAP53621 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
COPAP53621 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
COPAP53621 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
COPAP53621 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
COPAP53621 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
COPAP53621 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
COPAP53621 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
COPAP53621 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
COPAP53621 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
COPAP53621 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
COPAP53621 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
COPAP53621 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
COPAP53621 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
COPAP53621 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
COPAP53621 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
COPAP53621 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
COPAP53621 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
COPAP53621 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
COPAP53621 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
COPAP53621 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
COPAP53621 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
COPAP53621 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
COPAP53621 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.3 ms