Protein–RNA interactions for Protein: P52948

NUP98, Nuclear pore complex protein Nup98-Nup96, humanhuman

Predictions only

Length 1,817 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP98P52948 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
NUP98P52948 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
NUP98P52948 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
NUP98P52948 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
NUP98P52948 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
NUP98P52948 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
NUP98P52948 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
NUP98P52948 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
NUP98P52948 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
NUP98P52948 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
NUP98P52948 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
NUP98P52948 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
NUP98P52948 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
NUP98P52948 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
NUP98P52948 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
NUP98P52948 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
NUP98P52948 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
NUP98P52948 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
NUP98P52948 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
NUP98P52948 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
NUP98P52948 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
NUP98P52948 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
NUP98P52948 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
NUP98P52948 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
NUP98P52948 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
NUP98P52948 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
NUP98P52948 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
NUP98P52948 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
NUP98P52948 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
NUP98P52948 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
NUP98P52948 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
NUP98P52948 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
NUP98P52948 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
NUP98P52948 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
NUP98P52948 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
NUP98P52948 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
NUP98P52948 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
NUP98P52948 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
NUP98P52948 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
NUP98P52948 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
NUP98P52948 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
NUP98P52948 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
NUP98P52948 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
NUP98P52948 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
NUP98P52948 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
NUP98P52948 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
NUP98P52948 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
NUP98P52948 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
NUP98P52948 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
NUP98P52948 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
NUP98P52948 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
NUP98P52948 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
NUP98P52948 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
NUP98P52948 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
NUP98P52948 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
NUP98P52948 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
NUP98P52948 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
NUP98P52948 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
NUP98P52948 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
NUP98P52948 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
NUP98P52948 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
NUP98P52948 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
NUP98P52948 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
NUP98P52948 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
NUP98P52948 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC27.28■■□□□ 1.96
NUP98P52948 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
NUP98P52948 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
NUP98P52948 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC27.28■■□□□ 1.96
NUP98P52948 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
NUP98P52948 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
NUP98P52948 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
NUP98P52948 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
NUP98P52948 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
NUP98P52948 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
NUP98P52948 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
NUP98P52948 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
NUP98P52948 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
NUP98P52948 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
NUP98P52948 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
NUP98P52948 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
NUP98P52948 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
NUP98P52948 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
NUP98P52948 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC27.27■■□□□ 1.96
NUP98P52948 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
NUP98P52948 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
NUP98P52948 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
NUP98P52948 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
NUP98P52948 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
NUP98P52948 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
NUP98P52948 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
NUP98P52948 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
NUP98P52948 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
NUP98P52948 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
NUP98P52948 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
NUP98P52948 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
NUP98P52948 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
NUP98P52948 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
NUP98P52948 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
NUP98P52948 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
NUP98P52948 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms