Protein–RNA interactions for Protein: P52747

ZNF143, Zinc finger protein 143, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 638 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF143P52747 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNF143P52747 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNF143P52747 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNF143P52747 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNF143P52747 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNF143P52747 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNF143P52747 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNF143P52747 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNF143P52747 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNF143P52747 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNF143P52747 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNF143P52747 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNF143P52747 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNF143P52747 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNF143P52747 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNF143P52747 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNF143P52747 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNF143P52747 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNF143P52747 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNF143P52747 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNF143P52747 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNF143P52747 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNF143P52747 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZNF143P52747 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZNF143P52747 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZNF143P52747 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZNF143P52747 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
ZNF143P52747 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZNF143P52747 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZNF143P52747 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZNF143P52747 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZNF143P52747 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZNF143P52747 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZNF143P52747 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZNF143P52747 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZNF143P52747 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZNF143P52747 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
ZNF143P52747 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZNF143P52747 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZNF143P52747 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZNF143P52747 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZNF143P52747 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZNF143P52747 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZNF143P52747 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZNF143P52747 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZNF143P52747 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZNF143P52747 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZNF143P52747 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZNF143P52747 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZNF143P52747 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZNF143P52747 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ZNF143P52747 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.22
ZNF143P52747 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ZNF143P52747 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ZNF143P52747 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ZNF143P52747 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ZNF143P52747 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
ZNF143P52747 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
ZNF143P52747 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ZNF143P52747 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ZNF143P52747 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ZNF143P52747 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZNF143P52747 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZNF143P52747 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZNF143P52747 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZNF143P52747 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZNF143P52747 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
ZNF143P52747 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZNF143P52747 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZNF143P52747 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
ZNF143P52747 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZNF143P52747 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZNF143P52747 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZNF143P52747 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZNF143P52747 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZNF143P52747 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZNF143P52747 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZNF143P52747 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZNF143P52747 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZNF143P52747 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZNF143P52747 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZNF143P52747 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZNF143P52747 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZNF143P52747 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZNF143P52747 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZNF143P52747 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZNF143P52747 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
ZNF143P52747 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
ZNF143P52747 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZNF143P52747 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
ZNF143P52747 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZNF143P52747 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZNF143P52747 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
ZNF143P52747 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZNF143P52747 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZNF143P52747 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZNF143P52747 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZNF143P52747 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZNF143P52747 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZNF143P52747 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.2 ms