Protein–RNA interactions for Protein: P51793

CLCN4, H(+)/Cl(-) exchange transporter 4, humanhuman

Predictions only

Length 760 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLCN4P51793 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CLCN4P51793 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CLCN4P51793 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CLCN4P51793 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CLCN4P51793 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CLCN4P51793 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CLCN4P51793 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CLCN4P51793 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CLCN4P51793 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CLCN4P51793 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CLCN4P51793 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CLCN4P51793 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CLCN4P51793 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CLCN4P51793 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CLCN4P51793 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CLCN4P51793 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CLCN4P51793 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CLCN4P51793 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CLCN4P51793 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CLCN4P51793 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CLCN4P51793 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CLCN4P51793 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CLCN4P51793 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CLCN4P51793 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CLCN4P51793 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CLCN4P51793 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CLCN4P51793 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CLCN4P51793 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CLCN4P51793 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CLCN4P51793 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CLCN4P51793 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CLCN4P51793 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CLCN4P51793 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CLCN4P51793 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CLCN4P51793 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CLCN4P51793 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CLCN4P51793 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CLCN4P51793 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CLCN4P51793 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CLCN4P51793 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CLCN4P51793 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CLCN4P51793 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CLCN4P51793 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CLCN4P51793 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CLCN4P51793 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CLCN4P51793 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CLCN4P51793 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CLCN4P51793 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CLCN4P51793 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CLCN4P51793 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CLCN4P51793 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CLCN4P51793 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CLCN4P51793 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CLCN4P51793 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CLCN4P51793 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CLCN4P51793 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CLCN4P51793 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CLCN4P51793 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CLCN4P51793 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CLCN4P51793 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CLCN4P51793 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CLCN4P51793 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CLCN4P51793 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CLCN4P51793 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CLCN4P51793 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CLCN4P51793 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CLCN4P51793 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CLCN4P51793 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CLCN4P51793 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CLCN4P51793 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
CLCN4P51793 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
CLCN4P51793 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
CLCN4P51793 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CLCN4P51793 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CLCN4P51793 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CLCN4P51793 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CLCN4P51793 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CLCN4P51793 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CLCN4P51793 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CLCN4P51793 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CLCN4P51793 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CLCN4P51793 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CLCN4P51793 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CLCN4P51793 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CLCN4P51793 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CLCN4P51793 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CLCN4P51793 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CLCN4P51793 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CLCN4P51793 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CLCN4P51793 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CLCN4P51793 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CLCN4P51793 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CLCN4P51793 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CLCN4P51793 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CLCN4P51793 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CLCN4P51793 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CLCN4P51793 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CLCN4P51793 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CLCN4P51793 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CLCN4P51793 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.5 ms