Protein–RNA interactions for Protein: P51654

GPC3, Glypican-3, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC3P51654 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GPC3P51654 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GPC3P51654 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GPC3P51654 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GPC3P51654 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GPC3P51654 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GPC3P51654 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GPC3P51654 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GPC3P51654 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GPC3P51654 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
GPC3P51654 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GPC3P51654 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
GPC3P51654 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
GPC3P51654 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GPC3P51654 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GPC3P51654 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GPC3P51654 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GPC3P51654 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
GPC3P51654 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
GPC3P51654 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GPC3P51654 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
GPC3P51654 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
GPC3P51654 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC24■■□□□ 1.43
GPC3P51654 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GPC3P51654 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
GPC3P51654 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GPC3P51654 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GPC3P51654 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GPC3P51654 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GPC3P51654 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GPC3P51654 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GPC3P51654 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GPC3P51654 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GPC3P51654 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GPC3P51654 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GPC3P51654 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GPC3P51654 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GPC3P51654 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GPC3P51654 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GPC3P51654 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GPC3P51654 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GPC3P51654 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GPC3P51654 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GPC3P51654 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GPC3P51654 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GPC3P51654 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GPC3P51654 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
GPC3P51654 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
GPC3P51654 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GPC3P51654 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
GPC3P51654 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GPC3P51654 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GPC3P51654 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC23.97■■□□□ 1.43
GPC3P51654 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
GPC3P51654 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GPC3P51654 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
GPC3P51654 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
GPC3P51654 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
GPC3P51654 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
GPC3P51654 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GPC3P51654 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GPC3P51654 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GPC3P51654 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
GPC3P51654 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GPC3P51654 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GPC3P51654 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GPC3P51654 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GPC3P51654 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GPC3P51654 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GPC3P51654 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
GPC3P51654 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
GPC3P51654 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
GPC3P51654 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GPC3P51654 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GPC3P51654 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GPC3P51654 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
GPC3P51654 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
GPC3P51654 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
GPC3P51654 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
GPC3P51654 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
GPC3P51654 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
GPC3P51654 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GPC3P51654 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
GPC3P51654 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
GPC3P51654 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
GPC3P51654 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
GPC3P51654 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
GPC3P51654 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GPC3P51654 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GPC3P51654 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
GPC3P51654 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
GPC3P51654 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
GPC3P51654 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
GPC3P51654 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
GPC3P51654 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GPC3P51654 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
GPC3P51654 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
GPC3P51654 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
GPC3P51654 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GPC3P51654 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms