Protein–RNA interactions for Protein: P51531

SMARCA2, Probable global transcription activator SNF2L2, humanhuman

Predictions only

Length 1,590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA2P51531 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC39.15■■■■□ 3.86
SMARCA2P51531 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC39.15■■■■□ 3.86
SMARCA2P51531 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC39.15■■■■□ 3.86
SMARCA2P51531 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC39.15■■■■□ 3.86
SMARCA2P51531 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC39.15■■■■□ 3.86
SMARCA2P51531 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC39.15■■■■□ 3.86
SMARCA2P51531 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.15■■■■□ 3.86
SMARCA2P51531 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.15■■■■□ 3.86
SMARCA2P51531 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC39.14■■■■□ 3.86
SMARCA2P51531 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC39.14■■■■□ 3.86
SMARCA2P51531 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC39.13■■■■□ 3.86
SMARCA2P51531 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.13■■■■□ 3.86
SMARCA2P51531 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.13■■■■□ 3.86
SMARCA2P51531 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.13■■■■□ 3.85
SMARCA2P51531 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.13■■■■□ 3.85
SMARCA2P51531 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC39.13■■■■□ 3.85
SMARCA2P51531 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC39.13■■■■□ 3.85
SMARCA2P51531 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC39.12■■■■□ 3.85
SMARCA2P51531 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC39.12■■■■□ 3.85
SMARCA2P51531 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC39.12■■■■□ 3.85
SMARCA2P51531 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC39.12■■■■□ 3.85
SMARCA2P51531 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.12■■■■□ 3.85
SMARCA2P51531 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.12■■■■□ 3.85
SMARCA2P51531 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.12■■■■□ 3.85
SMARCA2P51531 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.12■■■■□ 3.85
SMARCA2P51531 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC39.12■■■■□ 3.85
SMARCA2P51531 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC39.12■■■■□ 3.85
SMARCA2P51531 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.11■■■■□ 3.85
SMARCA2P51531 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC39.11■■■■□ 3.85
SMARCA2P51531 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC39.11■■■■□ 3.85
SMARCA2P51531 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC39.11■■■■□ 3.85
SMARCA2P51531 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC39.11■■■■□ 3.85
SMARCA2P51531 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.11■■■■□ 3.85
SMARCA2P51531 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.11■■■■□ 3.85
SMARCA2P51531 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.1■■■■□ 3.85
SMARCA2P51531 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.1■■■■□ 3.85
SMARCA2P51531 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC39.1■■■■□ 3.85
SMARCA2P51531 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC39.09■■■■□ 3.85
SMARCA2P51531 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.09■■■■□ 3.85
SMARCA2P51531 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC39.09■■■■□ 3.85
SMARCA2P51531 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.09■■■■□ 3.85
SMARCA2P51531 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC39.09■■■■□ 3.85
SMARCA2P51531 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.08■■■■□ 3.85
SMARCA2P51531 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC39.08■■■■□ 3.85
SMARCA2P51531 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.08■■■■□ 3.85
SMARCA2P51531 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC39.08■■■■□ 3.85
SMARCA2P51531 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.08■■■■□ 3.85
SMARCA2P51531 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.08■■■■□ 3.85
SMARCA2P51531 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC39.08■■■■□ 3.85
SMARCA2P51531 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC39.08■■■■□ 3.85
SMARCA2P51531 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.08■■■■□ 3.85
SMARCA2P51531 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC39.08■■■■□ 3.85
SMARCA2P51531 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC39.08■■■■□ 3.85
SMARCA2P51531 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.08■■■■□ 3.85
SMARCA2P51531 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.07■■■■□ 3.84
SMARCA2P51531 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC39.07■■■■□ 3.84
SMARCA2P51531 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC39.07■■■■□ 3.84
SMARCA2P51531 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC39.07■■■■□ 3.84
SMARCA2P51531 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC39.07■■■■□ 3.84
SMARCA2P51531 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC39.07■■■■□ 3.84
SMARCA2P51531 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC39.07■■■■□ 3.84
SMARCA2P51531 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC39.06■■■■□ 3.84
SMARCA2P51531 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC39.06■■■■□ 3.84
SMARCA2P51531 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC39.06■■■■□ 3.84
SMARCA2P51531 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC39.06■■■■□ 3.84
SMARCA2P51531 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC39.05■■■■□ 3.84
SMARCA2P51531 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC39.05■■■■□ 3.84
SMARCA2P51531 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC39.05■■■■□ 3.84
SMARCA2P51531 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC39.05■■■■□ 3.84
SMARCA2P51531 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.05■■■■□ 3.84
SMARCA2P51531 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC39.05■■■■□ 3.84
SMARCA2P51531 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.05■■■■□ 3.84
SMARCA2P51531 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.05■■■■□ 3.84
SMARCA2P51531 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.04■■■■□ 3.84
SMARCA2P51531 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC39.04■■■■□ 3.84
SMARCA2P51531 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC39.04■■■■□ 3.84
SMARCA2P51531 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC39.04■■■■□ 3.84
SMARCA2P51531 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC39.04■■■■□ 3.84
SMARCA2P51531 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.03■■■■□ 3.84
SMARCA2P51531 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC39.03■■■■□ 3.84
SMARCA2P51531 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.03■■■■□ 3.84
SMARCA2P51531 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC39.03■■■■□ 3.84
SMARCA2P51531 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC39.03■■■■□ 3.84
SMARCA2P51531 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.02■■■■□ 3.84
SMARCA2P51531 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.02■■■■□ 3.84
SMARCA2P51531 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC39.02■■■■□ 3.84
SMARCA2P51531 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC39.02■■■■□ 3.84
SMARCA2P51531 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC39.02■■■■□ 3.84
SMARCA2P51531 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.01■■■■□ 3.84
SMARCA2P51531 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC39.01■■■■□ 3.84
SMARCA2P51531 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC39.01■■■■□ 3.84
SMARCA2P51531 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC39.01■■■■□ 3.84
SMARCA2P51531 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39■■■■□ 3.83
SMARCA2P51531 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39■■■■□ 3.83
SMARCA2P51531 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39■■■■□ 3.83
SMARCA2P51531 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC39■■■■□ 3.83
SMARCA2P51531 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39■■■■□ 3.83
SMARCA2P51531 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39■■■■□ 3.83
SMARCA2P51531 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC39■■■■□ 3.83
SMARCA2P51531 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC39■■■■□ 3.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50 ms