Protein–RNA interactions for Protein: P51160

PDE6C, Cone cGMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit alpha', humanhuman

Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE6CP51160 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PDE6CP51160 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PDE6CP51160 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
PDE6CP51160 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
PDE6CP51160 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PDE6CP51160 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PDE6CP51160 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PDE6CP51160 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PDE6CP51160 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PDE6CP51160 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PDE6CP51160 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PDE6CP51160 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PDE6CP51160 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PDE6CP51160 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PDE6CP51160 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PDE6CP51160 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PDE6CP51160 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PDE6CP51160 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PDE6CP51160 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PDE6CP51160 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PDE6CP51160 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PDE6CP51160 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PDE6CP51160 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PDE6CP51160 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PDE6CP51160 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PDE6CP51160 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PDE6CP51160 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PDE6CP51160 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PDE6CP51160 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PDE6CP51160 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PDE6CP51160 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
PDE6CP51160 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PDE6CP51160 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PDE6CP51160 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
PDE6CP51160 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PDE6CP51160 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PDE6CP51160 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PDE6CP51160 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PDE6CP51160 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PDE6CP51160 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PDE6CP51160 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PDE6CP51160 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PDE6CP51160 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
PDE6CP51160 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PDE6CP51160 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PDE6CP51160 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PDE6CP51160 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PDE6CP51160 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PDE6CP51160 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PDE6CP51160 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PDE6CP51160 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PDE6CP51160 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PDE6CP51160 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PDE6CP51160 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PDE6CP51160 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PDE6CP51160 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PDE6CP51160 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PDE6CP51160 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PDE6CP51160 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PDE6CP51160 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PDE6CP51160 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PDE6CP51160 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PDE6CP51160 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PDE6CP51160 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PDE6CP51160 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PDE6CP51160 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PDE6CP51160 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PDE6CP51160 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PDE6CP51160 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PDE6CP51160 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PDE6CP51160 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PDE6CP51160 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PDE6CP51160 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PDE6CP51160 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PDE6CP51160 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PDE6CP51160 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PDE6CP51160 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PDE6CP51160 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PDE6CP51160 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PDE6CP51160 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PDE6CP51160 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PDE6CP51160 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PDE6CP51160 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PDE6CP51160 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PDE6CP51160 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
PDE6CP51160 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PDE6CP51160 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
PDE6CP51160 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PDE6CP51160 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
PDE6CP51160 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PDE6CP51160 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PDE6CP51160 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PDE6CP51160 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PDE6CP51160 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PDE6CP51160 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
PDE6CP51160 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
PDE6CP51160 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PDE6CP51160 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PDE6CP51160 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PDE6CP51160 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms