Protein–RNA interactions for Protein: P49788

RARRES1, Retinoic acid receptor responder protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RARRES1P49788 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RARRES1P49788 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
RARRES1P49788 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RARRES1P49788 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
RARRES1P49788 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
RARRES1P49788 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
RARRES1P49788 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
RARRES1P49788 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
RARRES1P49788 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RARRES1P49788 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
RARRES1P49788 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RARRES1P49788 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RARRES1P49788 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RARRES1P49788 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RARRES1P49788 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RARRES1P49788 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
RARRES1P49788 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RARRES1P49788 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RARRES1P49788 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RARRES1P49788 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RARRES1P49788 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RARRES1P49788 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RARRES1P49788 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RARRES1P49788 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RARRES1P49788 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RARRES1P49788 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RARRES1P49788 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RARRES1P49788 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RARRES1P49788 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RARRES1P49788 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RARRES1P49788 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
RARRES1P49788 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
RARRES1P49788 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
RARRES1P49788 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RARRES1P49788 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RARRES1P49788 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RARRES1P49788 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RARRES1P49788 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RARRES1P49788 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RARRES1P49788 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RARRES1P49788 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RARRES1P49788 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RARRES1P49788 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RARRES1P49788 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RARRES1P49788 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RARRES1P49788 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RARRES1P49788 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RARRES1P49788 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RARRES1P49788 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RARRES1P49788 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RARRES1P49788 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RARRES1P49788 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RARRES1P49788 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RARRES1P49788 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RARRES1P49788 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RARRES1P49788 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RARRES1P49788 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RARRES1P49788 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RARRES1P49788 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RARRES1P49788 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RARRES1P49788 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RARRES1P49788 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RARRES1P49788 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RARRES1P49788 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RARRES1P49788 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RARRES1P49788 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RARRES1P49788 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RARRES1P49788 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RARRES1P49788 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RARRES1P49788 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RARRES1P49788 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RARRES1P49788 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RARRES1P49788 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RARRES1P49788 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RARRES1P49788 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RARRES1P49788 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RARRES1P49788 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RARRES1P49788 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RARRES1P49788 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RARRES1P49788 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RARRES1P49788 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RARRES1P49788 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RARRES1P49788 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RARRES1P49788 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RARRES1P49788 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
RARRES1P49788 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RARRES1P49788 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RARRES1P49788 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RARRES1P49788 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RARRES1P49788 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
RARRES1P49788 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
RARRES1P49788 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
RARRES1P49788 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
RARRES1P49788 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC24■■□□□ 1.43
RARRES1P49788 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
RARRES1P49788 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
RARRES1P49788 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC24■■□□□ 1.43
RARRES1P49788 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RARRES1P49788 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
RARRES1P49788 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms