Protein–RNA interactions for Protein: P49674

CSNK1E, Casein kinase I isoform epsilon, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK1EP49674 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CSNK1EP49674 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CSNK1EP49674 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CSNK1EP49674 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CSNK1EP49674 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CSNK1EP49674 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CSNK1EP49674 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CSNK1EP49674 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CSNK1EP49674 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CSNK1EP49674 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CSNK1EP49674 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CSNK1EP49674 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CSNK1EP49674 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CSNK1EP49674 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CSNK1EP49674 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CSNK1EP49674 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CSNK1EP49674 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CSNK1EP49674 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CSNK1EP49674 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CSNK1EP49674 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CSNK1EP49674 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CSNK1EP49674 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CSNK1EP49674 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CSNK1EP49674 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CSNK1EP49674 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CSNK1EP49674 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CSNK1EP49674 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CSNK1EP49674 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CSNK1EP49674 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CSNK1EP49674 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CSNK1EP49674 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CSNK1EP49674 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CSNK1EP49674 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CSNK1EP49674 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CSNK1EP49674 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CSNK1EP49674 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CSNK1EP49674 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CSNK1EP49674 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CSNK1EP49674 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CSNK1EP49674 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CSNK1EP49674 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CSNK1EP49674 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CSNK1EP49674 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CSNK1EP49674 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CSNK1EP49674 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CSNK1EP49674 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CSNK1EP49674 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CSNK1EP49674 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CSNK1EP49674 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CSNK1EP49674 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CSNK1EP49674 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CSNK1EP49674 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CSNK1EP49674 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CSNK1EP49674 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CSNK1EP49674 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CSNK1EP49674 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CSNK1EP49674 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CSNK1EP49674 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CSNK1EP49674 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CSNK1EP49674 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CSNK1EP49674 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CSNK1EP49674 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CSNK1EP49674 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CSNK1EP49674 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CSNK1EP49674 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CSNK1EP49674 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CSNK1EP49674 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CSNK1EP49674 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CSNK1EP49674 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CSNK1EP49674 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CSNK1EP49674 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CSNK1EP49674 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CSNK1EP49674 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CSNK1EP49674 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CSNK1EP49674 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CSNK1EP49674 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CSNK1EP49674 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CSNK1EP49674 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CSNK1EP49674 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CSNK1EP49674 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CSNK1EP49674 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CSNK1EP49674 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
CSNK1EP49674 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CSNK1EP49674 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CSNK1EP49674 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CSNK1EP49674 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CSNK1EP49674 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CSNK1EP49674 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
CSNK1EP49674 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CSNK1EP49674 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CSNK1EP49674 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CSNK1EP49674 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CSNK1EP49674 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CSNK1EP49674 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CSNK1EP49674 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CSNK1EP49674 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CSNK1EP49674 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CSNK1EP49674 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CSNK1EP49674 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CSNK1EP49674 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms