Protein–RNA interactions for Protein: P48556

PSMD8, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD8P48556 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PSMD8P48556 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PSMD8P48556 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PSMD8P48556 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PSMD8P48556 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PSMD8P48556 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
PSMD8P48556 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PSMD8P48556 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PSMD8P48556 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PSMD8P48556 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PSMD8P48556 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PSMD8P48556 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PSMD8P48556 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PSMD8P48556 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PSMD8P48556 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PSMD8P48556 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PSMD8P48556 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PSMD8P48556 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PSMD8P48556 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PSMD8P48556 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PSMD8P48556 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PSMD8P48556 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PSMD8P48556 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PSMD8P48556 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PSMD8P48556 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PSMD8P48556 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PSMD8P48556 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PSMD8P48556 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PSMD8P48556 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PSMD8P48556 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PSMD8P48556 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PSMD8P48556 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PSMD8P48556 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PSMD8P48556 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PSMD8P48556 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PSMD8P48556 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
PSMD8P48556 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PSMD8P48556 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PSMD8P48556 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PSMD8P48556 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PSMD8P48556 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PSMD8P48556 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PSMD8P48556 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PSMD8P48556 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PSMD8P48556 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PSMD8P48556 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PSMD8P48556 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
PSMD8P48556 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PSMD8P48556 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PSMD8P48556 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PSMD8P48556 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PSMD8P48556 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PSMD8P48556 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PSMD8P48556 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PSMD8P48556 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PSMD8P48556 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PSMD8P48556 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PSMD8P48556 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PSMD8P48556 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PSMD8P48556 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PSMD8P48556 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PSMD8P48556 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PSMD8P48556 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PSMD8P48556 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PSMD8P48556 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PSMD8P48556 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PSMD8P48556 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PSMD8P48556 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PSMD8P48556 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PSMD8P48556 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PSMD8P48556 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
PSMD8P48556 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
PSMD8P48556 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PSMD8P48556 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PSMD8P48556 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PSMD8P48556 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PSMD8P48556 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PSMD8P48556 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PSMD8P48556 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PSMD8P48556 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PSMD8P48556 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PSMD8P48556 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PSMD8P48556 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PSMD8P48556 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
PSMD8P48556 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
PSMD8P48556 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
PSMD8P48556 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PSMD8P48556 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PSMD8P48556 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PSMD8P48556 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PSMD8P48556 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PSMD8P48556 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
PSMD8P48556 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PSMD8P48556 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PSMD8P48556 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PSMD8P48556 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PSMD8P48556 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PSMD8P48556 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PSMD8P48556 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PSMD8P48556 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms