Protein–RNA interactions for Protein: P48165

GJA8, Gap junction alpha-8 protein, humanhuman

Predictions only

Length 433 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA8P48165 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
GJA8P48165 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GJA8P48165 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
GJA8P48165 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GJA8P48165 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GJA8P48165 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GJA8P48165 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
GJA8P48165 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
GJA8P48165 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
GJA8P48165 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GJA8P48165 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GJA8P48165 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GJA8P48165 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
GJA8P48165 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GJA8P48165 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GJA8P48165 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GJA8P48165 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
GJA8P48165 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GJA8P48165 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GJA8P48165 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GJA8P48165 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GJA8P48165 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GJA8P48165 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GJA8P48165 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GJA8P48165 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
GJA8P48165 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GJA8P48165 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GJA8P48165 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GJA8P48165 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GJA8P48165 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GJA8P48165 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GJA8P48165 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GJA8P48165 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GJA8P48165 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GJA8P48165 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GJA8P48165 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GJA8P48165 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
GJA8P48165 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GJA8P48165 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
GJA8P48165 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GJA8P48165 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GJA8P48165 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GJA8P48165 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
GJA8P48165 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GJA8P48165 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GJA8P48165 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GJA8P48165 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GJA8P48165 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GJA8P48165 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
GJA8P48165 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GJA8P48165 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GJA8P48165 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
GJA8P48165 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GJA8P48165 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GJA8P48165 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GJA8P48165 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GJA8P48165 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GJA8P48165 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GJA8P48165 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GJA8P48165 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GJA8P48165 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GJA8P48165 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GJA8P48165 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GJA8P48165 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GJA8P48165 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GJA8P48165 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GJA8P48165 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GJA8P48165 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GJA8P48165 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
GJA8P48165 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
GJA8P48165 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GJA8P48165 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GJA8P48165 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GJA8P48165 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GJA8P48165 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GJA8P48165 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GJA8P48165 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GJA8P48165 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GJA8P48165 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GJA8P48165 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GJA8P48165 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
GJA8P48165 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GJA8P48165 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
GJA8P48165 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GJA8P48165 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GJA8P48165 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GJA8P48165 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GJA8P48165 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GJA8P48165 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GJA8P48165 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GJA8P48165 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GJA8P48165 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GJA8P48165 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GJA8P48165 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GJA8P48165 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GJA8P48165 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GJA8P48165 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GJA8P48165 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GJA8P48165 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GJA8P48165 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms