Protein–RNA interactions for Protein: P45954

ACADSB, Short/branched chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACADSBP45954 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ACADSBP45954 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ACADSBP45954 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ACADSBP45954 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ACADSBP45954 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ACADSBP45954 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ACADSBP45954 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
ACADSBP45954 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ACADSBP45954 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ACADSBP45954 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ACADSBP45954 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
ACADSBP45954 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ACADSBP45954 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
ACADSBP45954 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ACADSBP45954 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ACADSBP45954 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
ACADSBP45954 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ACADSBP45954 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ACADSBP45954 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ACADSBP45954 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ACADSBP45954 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ACADSBP45954 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ACADSBP45954 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ACADSBP45954 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ACADSBP45954 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ACADSBP45954 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ACADSBP45954 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
ACADSBP45954 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ACADSBP45954 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ACADSBP45954 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ACADSBP45954 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ACADSBP45954 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ACADSBP45954 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ACADSBP45954 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ACADSBP45954 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ACADSBP45954 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ACADSBP45954 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ACADSBP45954 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ACADSBP45954 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ACADSBP45954 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ACADSBP45954 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ACADSBP45954 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
ACADSBP45954 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ACADSBP45954 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ACADSBP45954 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ACADSBP45954 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ACADSBP45954 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ACADSBP45954 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ACADSBP45954 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ACADSBP45954 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ACADSBP45954 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ACADSBP45954 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ACADSBP45954 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ACADSBP45954 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ACADSBP45954 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ACADSBP45954 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ACADSBP45954 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ACADSBP45954 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ACADSBP45954 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ACADSBP45954 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ACADSBP45954 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ACADSBP45954 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
ACADSBP45954 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ACADSBP45954 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ACADSBP45954 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ACADSBP45954 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ACADSBP45954 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ACADSBP45954 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ACADSBP45954 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ACADSBP45954 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ACADSBP45954 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ACADSBP45954 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ACADSBP45954 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
ACADSBP45954 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ACADSBP45954 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
ACADSBP45954 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ACADSBP45954 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ACADSBP45954 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ACADSBP45954 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ACADSBP45954 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ACADSBP45954 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ACADSBP45954 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ACADSBP45954 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ACADSBP45954 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ACADSBP45954 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ACADSBP45954 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ACADSBP45954 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ACADSBP45954 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ACADSBP45954 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ACADSBP45954 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
ACADSBP45954 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ACADSBP45954 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ACADSBP45954 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ACADSBP45954 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ACADSBP45954 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ACADSBP45954 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ACADSBP45954 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ACADSBP45954 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ACADSBP45954 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ACADSBP45954 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms