Protein–RNA interactions for Protein: P43681

CHRNA4, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA4P43681 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CHRNA4P43681 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CHRNA4P43681 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CHRNA4P43681 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CHRNA4P43681 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CHRNA4P43681 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CHRNA4P43681 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CHRNA4P43681 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
CHRNA4P43681 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CHRNA4P43681 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CHRNA4P43681 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
CHRNA4P43681 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
CHRNA4P43681 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CHRNA4P43681 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CHRNA4P43681 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CHRNA4P43681 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CHRNA4P43681 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CHRNA4P43681 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CHRNA4P43681 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CHRNA4P43681 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CHRNA4P43681 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CHRNA4P43681 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CHRNA4P43681 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CHRNA4P43681 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CHRNA4P43681 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CHRNA4P43681 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CHRNA4P43681 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CHRNA4P43681 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CHRNA4P43681 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CHRNA4P43681 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
CHRNA4P43681 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
CHRNA4P43681 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CHRNA4P43681 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CHRNA4P43681 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CHRNA4P43681 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CHRNA4P43681 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
CHRNA4P43681 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CHRNA4P43681 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CHRNA4P43681 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CHRNA4P43681 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CHRNA4P43681 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CHRNA4P43681 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
CHRNA4P43681 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
CHRNA4P43681 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CHRNA4P43681 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CHRNA4P43681 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CHRNA4P43681 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CHRNA4P43681 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
CHRNA4P43681 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CHRNA4P43681 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CHRNA4P43681 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CHRNA4P43681 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CHRNA4P43681 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CHRNA4P43681 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CHRNA4P43681 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CHRNA4P43681 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CHRNA4P43681 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CHRNA4P43681 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CHRNA4P43681 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CHRNA4P43681 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CHRNA4P43681 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CHRNA4P43681 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
CHRNA4P43681 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CHRNA4P43681 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CHRNA4P43681 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
CHRNA4P43681 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CHRNA4P43681 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CHRNA4P43681 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CHRNA4P43681 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CHRNA4P43681 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CHRNA4P43681 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CHRNA4P43681 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CHRNA4P43681 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CHRNA4P43681 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
CHRNA4P43681 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CHRNA4P43681 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
CHRNA4P43681 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CHRNA4P43681 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CHRNA4P43681 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CHRNA4P43681 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
CHRNA4P43681 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CHRNA4P43681 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CHRNA4P43681 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CHRNA4P43681 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CHRNA4P43681 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CHRNA4P43681 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CHRNA4P43681 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
CHRNA4P43681 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CHRNA4P43681 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CHRNA4P43681 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
CHRNA4P43681 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CHRNA4P43681 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
CHRNA4P43681 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CHRNA4P43681 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CHRNA4P43681 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CHRNA4P43681 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CHRNA4P43681 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CHRNA4P43681 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CHRNA4P43681 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CHRNA4P43681 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms