Protein–RNA interactions for Protein: P43357

MAGEA3, Melanoma-associated antigen 3, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAGEA3P43357 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
MAGEA3P43357 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
MAGEA3P43357 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
MAGEA3P43357 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
MAGEA3P43357 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
MAGEA3P43357 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
MAGEA3P43357 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
MAGEA3P43357 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
MAGEA3P43357 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
MAGEA3P43357 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
MAGEA3P43357 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
MAGEA3P43357 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
MAGEA3P43357 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
MAGEA3P43357 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
MAGEA3P43357 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
MAGEA3P43357 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MAGEA3P43357 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MAGEA3P43357 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MAGEA3P43357 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MAGEA3P43357 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MAGEA3P43357 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
MAGEA3P43357 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MAGEA3P43357 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MAGEA3P43357 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
MAGEA3P43357 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
MAGEA3P43357 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MAGEA3P43357 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
MAGEA3P43357 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
MAGEA3P43357 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
MAGEA3P43357 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MAGEA3P43357 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MAGEA3P43357 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
MAGEA3P43357 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
MAGEA3P43357 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
MAGEA3P43357 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MAGEA3P43357 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
MAGEA3P43357 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
MAGEA3P43357 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MAGEA3P43357 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
MAGEA3P43357 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
MAGEA3P43357 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
MAGEA3P43357 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MAGEA3P43357 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MAGEA3P43357 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
MAGEA3P43357 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MAGEA3P43357 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MAGEA3P43357 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
MAGEA3P43357 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
MAGEA3P43357 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
MAGEA3P43357 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
MAGEA3P43357 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
MAGEA3P43357 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
MAGEA3P43357 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
MAGEA3P43357 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
MAGEA3P43357 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
MAGEA3P43357 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
MAGEA3P43357 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
MAGEA3P43357 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
MAGEA3P43357 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
MAGEA3P43357 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MAGEA3P43357 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
MAGEA3P43357 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
MAGEA3P43357 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MAGEA3P43357 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
MAGEA3P43357 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
MAGEA3P43357 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
MAGEA3P43357 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
MAGEA3P43357 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
MAGEA3P43357 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
MAGEA3P43357 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MAGEA3P43357 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MAGEA3P43357 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MAGEA3P43357 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MAGEA3P43357 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
MAGEA3P43357 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MAGEA3P43357 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MAGEA3P43357 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
MAGEA3P43357 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
MAGEA3P43357 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
MAGEA3P43357 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
MAGEA3P43357 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
MAGEA3P43357 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
MAGEA3P43357 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
MAGEA3P43357 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
MAGEA3P43357 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
MAGEA3P43357 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
MAGEA3P43357 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
MAGEA3P43357 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
MAGEA3P43357 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
MAGEA3P43357 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
MAGEA3P43357 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
MAGEA3P43357 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
MAGEA3P43357 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
MAGEA3P43357 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
MAGEA3P43357 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
MAGEA3P43357 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
MAGEA3P43357 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
MAGEA3P43357 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
MAGEA3P43357 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
MAGEA3P43357 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms