Protein–RNA interactions for Protein: P43155

CRAT, Carnitine O-acetyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRATP43155 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CRATP43155 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CRATP43155 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CRATP43155 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CRATP43155 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CRATP43155 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CRATP43155 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CRATP43155 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CRATP43155 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CRATP43155 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
CRATP43155 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CRATP43155 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CRATP43155 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CRATP43155 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CRATP43155 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CRATP43155 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CRATP43155 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CRATP43155 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
CRATP43155 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CRATP43155 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CRATP43155 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CRATP43155 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CRATP43155 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CRATP43155 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CRATP43155 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CRATP43155 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CRATP43155 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
CRATP43155 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CRATP43155 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CRATP43155 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
CRATP43155 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CRATP43155 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CRATP43155 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CRATP43155 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CRATP43155 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CRATP43155 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CRATP43155 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CRATP43155 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CRATP43155 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CRATP43155 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CRATP43155 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CRATP43155 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CRATP43155 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CRATP43155 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CRATP43155 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CRATP43155 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CRATP43155 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CRATP43155 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CRATP43155 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CRATP43155 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CRATP43155 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CRATP43155 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CRATP43155 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CRATP43155 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CRATP43155 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CRATP43155 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CRATP43155 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CRATP43155 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CRATP43155 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CRATP43155 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CRATP43155 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CRATP43155 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
CRATP43155 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CRATP43155 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CRATP43155 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CRATP43155 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CRATP43155 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CRATP43155 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CRATP43155 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CRATP43155 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CRATP43155 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CRATP43155 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CRATP43155 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CRATP43155 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CRATP43155 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CRATP43155 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CRATP43155 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CRATP43155 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CRATP43155 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CRATP43155 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CRATP43155 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CRATP43155 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CRATP43155 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CRATP43155 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CRATP43155 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
CRATP43155 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
CRATP43155 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
CRATP43155 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
CRATP43155 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CRATP43155 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
CRATP43155 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CRATP43155 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CRATP43155 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CRATP43155 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CRATP43155 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CRATP43155 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CRATP43155 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CRATP43155 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CRATP43155 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
CRATP43155 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.1 ms