Protein–RNA interactions for Protein: P38235

YBR053C, Uncharacterized protein YBR053C, yeast

Predictions only

Length 358 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YBR053C	P38235	ARG4	YHR018C	1392 nt		4.58	□□□□□ -1.68
YBR053C	P38235	YCR085W	YCR085W	354 nt		4.58	□□□□□ -1.68
YBR053C	P38235	HNT2	YDR305C	654 nt		4.58	□□□□□ -1.68
YBR053C	P38235	URA3	YEL021W	804 nt		4.58	□□□□□ -1.68
YBR053C	P38235	YER145C-A	YER145C-A	438 nt		4.58	□□□□□ -1.68
YBR053C	P38235	MET14	YKL001C	609 nt		4.58	□□□□□ -1.68
YBR053C	P38235	ATP19	YOL077W-A	207 nt		4.58	□□□□□ -1.68
YBR053C	P38235	MIX23	YBL107C	591 nt		4.58	□□□□□ -1.68
YBR053C	P38235	PET123	YOR158W	957 nt		4.58	□□□□□ -1.68
YBR053C	P38235	YTA6	YPL074W	2265 nt		4.58	□□□□□ -1.68
YBR053C	P38235	LYP1	YNL268W	1836 nt		4.58	□□□□□ -1.68
YBR053C	P38235	DBF2	YGR092W	1719 nt		4.58	□□□□□ -1.68
YBR053C	P38235	NGL3	YML118W	1518 nt		4.57	□□□□□ -1.68
YBR053C	P38235	MTH1	YDR277C	1302 nt		4.57	□□□□□ -1.68
YBR053C	P38235	GTR2	YGR163W	1026 nt		4.57	□□□□□ -1.68
YBR053C	P38235	YJL028W	YJL028W	336 nt		4.57	□□□□□ -1.68
YBR053C	P38235	YJR085C	YJR085C	318 nt		4.57	□□□□□ -1.68
YBR053C	P38235	CCE1	YKL011C	1062 nt		4.57	□□□□□ -1.68
YBR053C	P38235	MIC27	YNL100W	705 nt		4.57	□□□□□ -1.68
YBR053C	P38235	RIB4	YOL143C	510 nt		4.57	□□□□□ -1.68
YBR053C	P38235	BUB3	YOR026W	1026 nt		4.57	□□□□□ -1.68
YBR053C	P38235	YOR366W	YOR366W	354 nt		4.57	□□□□□ -1.68
YBR053C	P38235	YPR172W	YPR172W	603 nt		4.57	□□□□□ -1.68
YBR053C	P38235	RIB5	YBR256C	717 nt		4.57	□□□□□ -1.68
YBR053C	P38235	ARN1	YHL040C	1884 nt		4.57	□□□□□ -1.68
YBR053C	P38235	GPB1	YOR371C	2694 nt		4.57	□□□□□ -1.68
YBR053C	P38235	PSE1	YMR308C	3270 nt		4.56	□□□□□ -1.68
YBR053C	P38235	ENT1	YDL161W	1365 nt		4.56	□□□□□ -1.68
YBR053C	P38235	TPS3	YMR261C	3165 nt		4.56	□□□□□ -1.68
YBR053C	P38235	YCR101C	YCR101C	549 nt		4.56	□□□□□ -1.68
YBR053C	P38235	BUD25	YER014C-A	462 nt		4.56	□□□□□ -1.68
YBR053C	P38235	YGL006W-A	YGL006W-A	111 nt		4.56	□□□□□ -1.68
YBR053C	P38235	COX18	YGR062C	951 nt		4.56	□□□□□ -1.68
YBR053C	P38235	YGR109W-A	YGR109W-A	873 nt		4.56	□□□□□ -1.68
YBR053C	P38235	YIL082W	YIL082W	873 nt		4.56	□□□□□ -1.68
YBR053C	P38235	YPT52	YKR014C	705 nt		4.56	□□□□□ -1.68
YBR053C	P38235	CMS1	YLR003C	876 nt		4.56	□□□□□ -1.68
YBR053C	P38235	SAS2	YMR127C	1017 nt		4.56	□□□□□ -1.68
YBR053C	P38235	YMR130W	YMR130W	909 nt		4.56	□□□□□ -1.68
YBR053C	P38235	CSI2	YOL007C	1026 nt		4.56	□□□□□ -1.68
YBR053C	P38235	SPC29	YPL124W	762 nt		4.56	□□□□□ -1.68
YBR053C	P38235	RXT2	YBR095C	1293 nt		4.56	□□□□□ -1.68
YBR053C	P38235	MET12	YPL023C	1974 nt		4.56	□□□□□ -1.68
YBR053C	P38235	AZR1	YGR224W	1842 nt		4.56	□□□□□ -1.68
YBR053C	P38235	PAN1	YIR006C	4443 nt		4.55	□□□□□ -1.68
YBR053C	P38235	TAF10	YDR167W	621 nt		4.55	□□□□□ -1.68
YBR053C	P38235	YDR545C-A	YDR545C-A	480 nt		4.55	□□□□□ -1.68
YBR053C	P38235	YEL077W-A	YEL077W-A	483 nt		4.55	□□□□□ -1.68
YBR053C	P38235	YER190C-B	YER190C-B	483 nt		4.55	□□□□□ -1.68
YBR053C	P38235	SNO3	YFL060C	669 nt		4.55	□□□□□ -1.68
YBR053C	P38235	YFL068W	YFL068W	483 nt		4.55	□□□□□ -1.68
YBR053C	P38235	YGL138C	YGL138C	1038 nt		4.55	□□□□□ -1.68
YBR053C	P38235	YGR122W	YGR122W	1209 nt		4.55	□□□□□ -1.68
YBR053C	P38235	YGR296C-B	YGR296C-B	483 nt		4.55	□□□□□ -1.68
YBR053C	P38235	YHL050W-A	YHL050W-A	483 nt		4.55	□□□□□ -1.68
YBR053C	P38235	YHR219C-A	YHR219C-A	483 nt		4.55	□□□□□ -1.68
YBR053C	P38235	YIL177W-A	YIL177W-A	483 nt		4.55	□□□□□ -1.68
YBR053C	P38235	MNN11	YJL183W	1269 nt		4.55	□□□□□ -1.68
YBR053C	P38235	YJL225W-A	YJL225W-A	483 nt		4.55	□□□□□ -1.68
YBR053C	P38235	YAL047W-A	YAL047W-A	330 nt		4.55	□□□□□ -1.68
YBR053C	P38235	YLL066W-A	YLL066W-A	483 nt		4.55	□□□□□ -1.68
YBR053C	P38235	YLL067W-A	YLL067W-A	483 nt		4.55	□□□□□ -1.68
YBR053C	P38235	YLR466C-A	YLR466C-A	483 nt		4.55	□□□□□ -1.68
YBR053C	P38235	YLR467C-A	YLR467C-A	483 nt		4.55	□□□□□ -1.68
YBR053C	P38235	YML133W-B	YML133W-B	483 nt		4.55	□□□□□ -1.68
YBR053C	P38235	RRN9	YMR270C	1098 nt		4.55	□□□□□ -1.68
YBR053C	P38235	YBL059W	YBL059W	582 nt		4.55	□□□□□ -1.68
YBR053C	P38235	SNO2	YNL334C	669 nt		4.55	□□□□□ -1.68
YBR053C	P38235	YNL339W-B	YNL339W-B	483 nt		4.55	□□□□□ -1.68
YBR053C	P38235	YBL113W-A	YBL113W-A	483 nt		4.55	□□□□□ -1.68
YBR053C	P38235	YOR396C-A	YOR396C-A	483 nt		4.55	□□□□□ -1.68
YBR053C	P38235	YPL283W-B	YPL283W-B	483 nt		4.55	□□□□□ -1.68
YBR053C	P38235	YPR204C-A	YPR204C-A	483 nt		4.55	□□□□□ -1.68
YBR053C	P38235	YCL002C	YCL002C	792 nt		4.55	□□□□□ -1.68
YBR053C	P38235	GAS3	YMR215W	1575 nt		4.55	□□□□□ -1.68
YBR053C	P38235	ADE6	YGR061C	4077 nt		4.55	□□□□□ -1.68
YBR053C	P38235	MPS3	YJL019W	2049 nt		4.55	□□□□□ -1.68
YBR053C	P38235	CTK1	YKL139W	1587 nt		4.54	□□□□□ -1.68
YBR053C	P38235	NUS1	YDL193W	1128 nt		4.54	□□□□□ -1.68
YBR053C	P38235	TAN1	YGL232W	870 nt		4.54	□□□□□ -1.68
YBR053C	P38235	YGR126W	YGR126W	693 nt		4.54	□□□□□ -1.68
YBR053C	P38235	LSO1	YJR005C-A	282 nt		4.54	□□□□□ -1.68
YBR053C	P38235	HXT5	YHR096C	1779 nt		4.54	□□□□□ -1.68
YBR053C	P38235	CRT10	YOL063C	2874 nt		4.54	□□□□□ -1.68
YBR053C	P38235	HSP82	YPL240C	2130 nt		4.54	□□□□□ -1.68
YBR053C	P38235	CAB3	YKL088W	1716 nt		4.53	□□□□□ -1.68
YBR053C	P38235	UBC8	YEL012W	657 nt		4.53	□□□□□ -1.68
YBR053C	P38235	GSY1	YFR015C	2127 nt		4.53	□□□□□ -1.68
YBR053C	P38235	YGR042W	YGR042W	816 nt		4.53	□□□□□ -1.68
YBR053C	P38235	YGR160W	YGR160W	612 nt		4.53	□□□□□ -1.68
YBR053C	P38235	YGR293C	YGR293C	462 nt		4.53	□□□□□ -1.68
YBR053C	P38235	YLR264C-A	YLR264C-A	117 nt		4.53	□□□□□ -1.68
YBR053C	P38235	RPS30A	YLR287C-A	192 nt		4.53	□□□□□ -1.68
YBR053C	P38235	ECM13	YBL043W	774 nt		4.53	□□□□□ -1.68
YBR053C	P38235	SSO2	YMR183C	888 nt		4.53	□□□□□ -1.68
YBR053C	P38235	YBR300C	YBR300C	498 nt		4.53	□□□□□ -1.68
YBR053C	P38235	SEG2	YKL105C	3399 nt		4.53	□□□□□ -1.68
YBR053C	P38235	APN2	YBL019W	1563 nt		4.53	□□□□□ -1.69
YBR053C	P38235	SWC3	YAL011W	1878 nt		4.52	□□□□□ -1.69
YBR053C	P38235	ERP3	YDL018C	678 nt		4.52	□□□□□ -1.69

Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 25.1 ms