Protein–RNA interactions for Protein: P35908

KRT2, Keratin, type II cytoskeletal 2 epidermal, humanhuman

Predictions only

Length 639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT2P35908 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
KRT2P35908 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
KRT2P35908 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
KRT2P35908 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
KRT2P35908 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
KRT2P35908 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
KRT2P35908 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
KRT2P35908 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
KRT2P35908 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
KRT2P35908 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
KRT2P35908 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
KRT2P35908 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
KRT2P35908 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
KRT2P35908 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
KRT2P35908 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
KRT2P35908 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
KRT2P35908 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
KRT2P35908 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
KRT2P35908 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
KRT2P35908 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
KRT2P35908 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
KRT2P35908 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
KRT2P35908 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
KRT2P35908 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
KRT2P35908 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC24.89■■□□□ 1.58
KRT2P35908 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
KRT2P35908 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
KRT2P35908 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
KRT2P35908 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
KRT2P35908 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
KRT2P35908 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
KRT2P35908 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
KRT2P35908 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
KRT2P35908 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
KRT2P35908 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
KRT2P35908 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
KRT2P35908 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
KRT2P35908 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
KRT2P35908 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
KRT2P35908 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.88■■□□□ 1.57
KRT2P35908 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
KRT2P35908 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
KRT2P35908 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
KRT2P35908 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
KRT2P35908 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
KRT2P35908 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
KRT2P35908 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
KRT2P35908 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
KRT2P35908 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
KRT2P35908 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
KRT2P35908 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
KRT2P35908 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
KRT2P35908 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
KRT2P35908 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
KRT2P35908 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
KRT2P35908 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
KRT2P35908 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
KRT2P35908 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
KRT2P35908 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
KRT2P35908 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
KRT2P35908 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
KRT2P35908 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
KRT2P35908 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
KRT2P35908 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
KRT2P35908 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
KRT2P35908 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
KRT2P35908 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
KRT2P35908 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
KRT2P35908 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
KRT2P35908 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
KRT2P35908 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
KRT2P35908 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
KRT2P35908 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
KRT2P35908 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
KRT2P35908 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
KRT2P35908 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
KRT2P35908 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
KRT2P35908 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
KRT2P35908 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
KRT2P35908 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
KRT2P35908 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
KRT2P35908 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
KRT2P35908 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
KRT2P35908 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
KRT2P35908 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
KRT2P35908 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
KRT2P35908 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
KRT2P35908 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
KRT2P35908 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
KRT2P35908 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
KRT2P35908 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
KRT2P35908 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
KRT2P35908 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
KRT2P35908 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
KRT2P35908 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
KRT2P35908 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
KRT2P35908 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
KRT2P35908 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
KRT2P35908 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
KRT2P35908 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms