Protein–RNA interactions for Protein: P35453

HOXD13, Homeobox protein Hox-D13, humanhuman

Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD13P35453 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
HOXD13P35453 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
HOXD13P35453 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
HOXD13P35453 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
HOXD13P35453 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
HOXD13P35453 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
HOXD13P35453 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.84■■□□□ 1.41
HOXD13P35453 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
HOXD13P35453 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
HOXD13P35453 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
HOXD13P35453 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
HOXD13P35453 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
HOXD13P35453 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
HOXD13P35453 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
HOXD13P35453 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
HOXD13P35453 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
HOXD13P35453 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
HOXD13P35453 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
HOXD13P35453 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
HOXD13P35453 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
HOXD13P35453 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
HOXD13P35453 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
HOXD13P35453 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
HOXD13P35453 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
HOXD13P35453 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
HOXD13P35453 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC23.83■■□□□ 1.4
HOXD13P35453 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
HOXD13P35453 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
HOXD13P35453 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
HOXD13P35453 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
HOXD13P35453 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
HOXD13P35453 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
HOXD13P35453 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
HOXD13P35453 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
HOXD13P35453 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
HOXD13P35453 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
HOXD13P35453 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
HOXD13P35453 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
HOXD13P35453 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
HOXD13P35453 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
HOXD13P35453 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
HOXD13P35453 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
HOXD13P35453 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
HOXD13P35453 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
HOXD13P35453 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
HOXD13P35453 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
HOXD13P35453 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
HOXD13P35453 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
HOXD13P35453 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
HOXD13P35453 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
HOXD13P35453 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
HOXD13P35453 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
HOXD13P35453 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
HOXD13P35453 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
HOXD13P35453 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
HOXD13P35453 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
HOXD13P35453 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
HOXD13P35453 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
HOXD13P35453 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
HOXD13P35453 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
HOXD13P35453 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
HOXD13P35453 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
HOXD13P35453 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
HOXD13P35453 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
HOXD13P35453 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
HOXD13P35453 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
HOXD13P35453 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
HOXD13P35453 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
HOXD13P35453 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
HOXD13P35453 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
HOXD13P35453 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
HOXD13P35453 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
HOXD13P35453 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
HOXD13P35453 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
HOXD13P35453 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
HOXD13P35453 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
HOXD13P35453 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
HOXD13P35453 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
HOXD13P35453 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
HOXD13P35453 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
HOXD13P35453 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
HOXD13P35453 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
HOXD13P35453 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
HOXD13P35453 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
HOXD13P35453 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
HOXD13P35453 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
HOXD13P35453 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
HOXD13P35453 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
HOXD13P35453 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
HOXD13P35453 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
HOXD13P35453 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
HOXD13P35453 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
HOXD13P35453 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
HOXD13P35453 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
HOXD13P35453 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
HOXD13P35453 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
HOXD13P35453 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
HOXD13P35453 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
HOXD13P35453 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
HOXD13P35453 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 144.4 ms