Protein–RNA interactions for Protein: P32246

CCR1, C-C chemokine receptor type 1, humanhuman

Predictions only

Length 355 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCR1P32246 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCR1P32246 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CCR1P32246 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CCR1P32246 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CCR1P32246 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CCR1P32246 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCR1P32246 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCR1P32246 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCR1P32246 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCR1P32246 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCR1P32246 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCR1P32246 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCR1P32246 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCR1P32246 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCR1P32246 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCR1P32246 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCR1P32246 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCR1P32246 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCR1P32246 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CCR1P32246 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCR1P32246 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CCR1P32246 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCR1P32246 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCR1P32246 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCR1P32246 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCR1P32246 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCR1P32246 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCR1P32246 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCR1P32246 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCR1P32246 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCR1P32246 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCR1P32246 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCR1P32246 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCR1P32246 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCR1P32246 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCR1P32246 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCR1P32246 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CCR1P32246 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCR1P32246 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCR1P32246 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCR1P32246 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCR1P32246 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCR1P32246 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCR1P32246 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCR1P32246 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCR1P32246 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCR1P32246 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCR1P32246 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCR1P32246 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCR1P32246 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CCR1P32246 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCR1P32246 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCR1P32246 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCR1P32246 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCR1P32246 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCR1P32246 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CCR1P32246 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCR1P32246 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCR1P32246 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCR1P32246 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCR1P32246 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CCR1P32246 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCR1P32246 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCR1P32246 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCR1P32246 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCR1P32246 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCR1P32246 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCR1P32246 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCR1P32246 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCR1P32246 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCR1P32246 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCR1P32246 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCR1P32246 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCR1P32246 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCR1P32246 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCR1P32246 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCR1P32246 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCR1P32246 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCR1P32246 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCR1P32246 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCR1P32246 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CCR1P32246 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCR1P32246 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCR1P32246 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCR1P32246 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCR1P32246 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCR1P32246 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCR1P32246 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCR1P32246 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCR1P32246 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCR1P32246 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCR1P32246 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCR1P32246 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCR1P32246 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCR1P32246 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CCR1P32246 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCR1P32246 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCR1P32246 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCR1P32246 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCR1P32246 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms