Protein–RNA interactions for Protein: P31275

HOXC12, Homeobox protein Hox-C12, humanhuman

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC12P31275 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
HOXC12P31275 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
HOXC12P31275 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
HOXC12P31275 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
HOXC12P31275 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
HOXC12P31275 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
HOXC12P31275 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
HOXC12P31275 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
HOXC12P31275 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
HOXC12P31275 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
HOXC12P31275 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
HOXC12P31275 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
HOXC12P31275 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
HOXC12P31275 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
HOXC12P31275 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
HOXC12P31275 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
HOXC12P31275 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
HOXC12P31275 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
HOXC12P31275 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
HOXC12P31275 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
HOXC12P31275 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
HOXC12P31275 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
HOXC12P31275 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
HOXC12P31275 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC19.16■□□□□ 0.66
HOXC12P31275 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
HOXC12P31275 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
HOXC12P31275 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
HOXC12P31275 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
HOXC12P31275 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HOXC12P31275 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HOXC12P31275 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
HOXC12P31275 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
HOXC12P31275 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.15■□□□□ 0.66
HOXC12P31275 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
HOXC12P31275 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC19.15■□□□□ 0.66
HOXC12P31275 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC19.15■□□□□ 0.66
HOXC12P31275 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
HOXC12P31275 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HOXC12P31275 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HOXC12P31275 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
HOXC12P31275 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
HOXC12P31275 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
HOXC12P31275 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
HOXC12P31275 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
HOXC12P31275 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
HOXC12P31275 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
HOXC12P31275 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
HOXC12P31275 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
HOXC12P31275 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
HOXC12P31275 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
HOXC12P31275 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
HOXC12P31275 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
HOXC12P31275 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
HOXC12P31275 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
HOXC12P31275 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
HOXC12P31275 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
HOXC12P31275 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
HOXC12P31275 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
HOXC12P31275 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
HOXC12P31275 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HOXC12P31275 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HOXC12P31275 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HOXC12P31275 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HOXC12P31275 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HOXC12P31275 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HOXC12P31275 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HOXC12P31275 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HOXC12P31275 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HOXC12P31275 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HOXC12P31275 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HOXC12P31275 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HOXC12P31275 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HOXC12P31275 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HOXC12P31275 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HOXC12P31275 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HOXC12P31275 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HOXC12P31275 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HOXC12P31275 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HOXC12P31275 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HOXC12P31275 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HOXC12P31275 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HOXC12P31275 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HOXC12P31275 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HOXC12P31275 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HOXC12P31275 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HOXC12P31275 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HOXC12P31275 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HOXC12P31275 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HOXC12P31275 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HOXC12P31275 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HOXC12P31275 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
HOXC12P31275 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
HOXC12P31275 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HOXC12P31275 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HOXC12P31275 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HOXC12P31275 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HOXC12P31275 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
HOXC12P31275 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HOXC12P31275 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HOXC12P31275 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.4 ms