Protein–RNA interactions for Protein: P31268

HOXA7, Homeobox protein Hox-A7, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA7P31268 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
HOXA7P31268 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
HOXA7P31268 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
HOXA7P31268 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
HOXA7P31268 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
HOXA7P31268 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
HOXA7P31268 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
HOXA7P31268 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
HOXA7P31268 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC25.29■■□□□ 1.64
HOXA7P31268 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
HOXA7P31268 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
HOXA7P31268 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
HOXA7P31268 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
HOXA7P31268 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
HOXA7P31268 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
HOXA7P31268 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
HOXA7P31268 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
HOXA7P31268 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
HOXA7P31268 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
HOXA7P31268 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
HOXA7P31268 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
HOXA7P31268 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
HOXA7P31268 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
HOXA7P31268 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
HOXA7P31268 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC25.27■■□□□ 1.64
HOXA7P31268 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
HOXA7P31268 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
HOXA7P31268 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
HOXA7P31268 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
HOXA7P31268 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
HOXA7P31268 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
HOXA7P31268 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
HOXA7P31268 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
HOXA7P31268 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
HOXA7P31268 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
HOXA7P31268 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
HOXA7P31268 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
HOXA7P31268 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
HOXA7P31268 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
HOXA7P31268 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
HOXA7P31268 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
HOXA7P31268 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
HOXA7P31268 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
HOXA7P31268 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
HOXA7P31268 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
HOXA7P31268 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
HOXA7P31268 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
HOXA7P31268 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
HOXA7P31268 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
HOXA7P31268 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
HOXA7P31268 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
HOXA7P31268 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
HOXA7P31268 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
HOXA7P31268 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
HOXA7P31268 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
HOXA7P31268 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
HOXA7P31268 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
HOXA7P31268 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
HOXA7P31268 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
HOXA7P31268 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
HOXA7P31268 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
HOXA7P31268 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
HOXA7P31268 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
HOXA7P31268 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
HOXA7P31268 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC25.23■■□□□ 1.63
HOXA7P31268 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
HOXA7P31268 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
HOXA7P31268 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
HOXA7P31268 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
HOXA7P31268 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
HOXA7P31268 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
HOXA7P31268 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
HOXA7P31268 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
HOXA7P31268 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
HOXA7P31268 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
HOXA7P31268 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
HOXA7P31268 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
HOXA7P31268 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
HOXA7P31268 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
HOXA7P31268 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
HOXA7P31268 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
HOXA7P31268 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
HOXA7P31268 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
HOXA7P31268 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
HOXA7P31268 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
HOXA7P31268 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
HOXA7P31268 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
HOXA7P31268 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
HOXA7P31268 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
HOXA7P31268 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
HOXA7P31268 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
HOXA7P31268 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
HOXA7P31268 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
HOXA7P31268 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
HOXA7P31268 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
HOXA7P31268 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
HOXA7P31268 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
HOXA7P31268 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
HOXA7P31268 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
HOXA7P31268 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms