Protein–RNA interactions for Protein: P30622

CLIP1, CAP-Gly domain-containing linker protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP1P30622 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
CLIP1P30622 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
CLIP1P30622 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.65■■■■□ 3.14
CLIP1P30622 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.65■■■■□ 3.14
CLIP1P30622 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC34.65■■■■□ 3.14
CLIP1P30622 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
CLIP1P30622 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC34.65■■■■□ 3.14
CLIP1P30622 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.65■■■■□ 3.14
CLIP1P30622 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC34.65■■■■□ 3.14
CLIP1P30622 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
CLIP1P30622 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC34.64■■■■□ 3.14
CLIP1P30622 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC34.64■■■■□ 3.14
CLIP1P30622 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC34.64■■■■□ 3.14
CLIP1P30622 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC34.64■■■■□ 3.14
CLIP1P30622 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC34.64■■■■□ 3.14
CLIP1P30622 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
CLIP1P30622 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
CLIP1P30622 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC34.64■■■■□ 3.14
CLIP1P30622 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
CLIP1P30622 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC34.64■■■■□ 3.14
CLIP1P30622 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC34.64■■■■□ 3.14
CLIP1P30622 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC34.64■■■■□ 3.14
CLIP1P30622 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
CLIP1P30622 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
CLIP1P30622 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC34.64■■■■□ 3.14
CLIP1P30622 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.64■■■■□ 3.14
CLIP1P30622 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC34.64■■■■□ 3.14
CLIP1P30622 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
CLIP1P30622 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC34.63■■■■□ 3.14
CLIP1P30622 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
CLIP1P30622 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC34.63■■■■□ 3.13
CLIP1P30622 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC34.63■■■■□ 3.13
CLIP1P30622 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
CLIP1P30622 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.63■■■■□ 3.13
CLIP1P30622 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
CLIP1P30622 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
CLIP1P30622 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC34.62■■■■□ 3.13
CLIP1P30622 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
CLIP1P30622 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.62■■■■□ 3.13
CLIP1P30622 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC34.62■■■■□ 3.13
CLIP1P30622 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC34.61■■■■□ 3.13
CLIP1P30622 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC34.61■■■■□ 3.13
CLIP1P30622 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC34.61■■■■□ 3.13
CLIP1P30622 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
CLIP1P30622 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC34.61■■■■□ 3.13
CLIP1P30622 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC34.61■■■■□ 3.13
CLIP1P30622 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC34.61■■■■□ 3.13
CLIP1P30622 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
CLIP1P30622 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
CLIP1P30622 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC34.6■■■■□ 3.13
CLIP1P30622 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.6■■■■□ 3.13
CLIP1P30622 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC34.6■■■■□ 3.13
CLIP1P30622 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC34.6■■■■□ 3.13
CLIP1P30622 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC34.6■■■■□ 3.13
CLIP1P30622 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC34.6■■■■□ 3.13
CLIP1P30622 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
CLIP1P30622 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC34.6■■■■□ 3.13
CLIP1P30622 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.59■■■■□ 3.13
CLIP1P30622 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
CLIP1P30622 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
CLIP1P30622 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
CLIP1P30622 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.59■■■■□ 3.13
CLIP1P30622 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC34.59■■■■□ 3.13
CLIP1P30622 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
CLIP1P30622 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
CLIP1P30622 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
CLIP1P30622 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
CLIP1P30622 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
CLIP1P30622 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.58■■■■□ 3.13
CLIP1P30622 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC34.58■■■■□ 3.13
CLIP1P30622 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC34.58■■■■□ 3.13
CLIP1P30622 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
CLIP1P30622 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC34.58■■■■□ 3.13
CLIP1P30622 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC34.57■■■■□ 3.13
CLIP1P30622 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
CLIP1P30622 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.56■■■■□ 3.12
CLIP1P30622 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
CLIP1P30622 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC34.56■■■■□ 3.12
CLIP1P30622 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC34.56■■■■□ 3.12
CLIP1P30622 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
CLIP1P30622 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
CLIP1P30622 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
CLIP1P30622 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC34.56■■■■□ 3.12
CLIP1P30622 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
CLIP1P30622 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC34.55■■■■□ 3.12
CLIP1P30622 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
CLIP1P30622 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
CLIP1P30622 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC34.55■■■■□ 3.12
CLIP1P30622 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
CLIP1P30622 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC34.55■■■■□ 3.12
CLIP1P30622 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC34.55■■■■□ 3.12
CLIP1P30622 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC34.55■■■■□ 3.12
CLIP1P30622 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC34.55■■■■□ 3.12
CLIP1P30622 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
CLIP1P30622 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC34.54■■■■□ 3.12
CLIP1P30622 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC34.54■■■■□ 3.12
CLIP1P30622 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
CLIP1P30622 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC34.54■■■■□ 3.12
CLIP1P30622 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
CLIP1P30622 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.5 ms