Protein–RNA interactions for Protein: P30511

HLA-F, HLA class I histocompatibility antigen, alpha chain F, humanhuman

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-FP30511 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HLA-FP30511 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HLA-FP30511 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HLA-FP30511 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HLA-FP30511 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HLA-FP30511 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HLA-FP30511 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HLA-FP30511 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HLA-FP30511 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HLA-FP30511 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HLA-FP30511 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HLA-FP30511 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
HLA-FP30511 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HLA-FP30511 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HLA-FP30511 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HLA-FP30511 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HLA-FP30511 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
HLA-FP30511 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HLA-FP30511 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HLA-FP30511 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HLA-FP30511 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HLA-FP30511 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HLA-FP30511 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HLA-FP30511 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HLA-FP30511 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HLA-FP30511 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
HLA-FP30511 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HLA-FP30511 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HLA-FP30511 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HLA-FP30511 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HLA-FP30511 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HLA-FP30511 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HLA-FP30511 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
HLA-FP30511 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HLA-FP30511 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HLA-FP30511 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HLA-FP30511 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HLA-FP30511 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HLA-FP30511 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HLA-FP30511 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HLA-FP30511 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HLA-FP30511 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HLA-FP30511 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HLA-FP30511 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HLA-FP30511 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HLA-FP30511 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HLA-FP30511 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HLA-FP30511 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
HLA-FP30511 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HLA-FP30511 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
HLA-FP30511 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HLA-FP30511 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HLA-FP30511 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HLA-FP30511 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HLA-FP30511 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HLA-FP30511 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HLA-FP30511 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HLA-FP30511 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HLA-FP30511 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HLA-FP30511 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HLA-FP30511 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HLA-FP30511 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HLA-FP30511 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HLA-FP30511 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HLA-FP30511 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
HLA-FP30511 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HLA-FP30511 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HLA-FP30511 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HLA-FP30511 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HLA-FP30511 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HLA-FP30511 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HLA-FP30511 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HLA-FP30511 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
HLA-FP30511 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
HLA-FP30511 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
HLA-FP30511 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
HLA-FP30511 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
HLA-FP30511 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HLA-FP30511 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HLA-FP30511 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HLA-FP30511 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HLA-FP30511 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
HLA-FP30511 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HLA-FP30511 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
HLA-FP30511 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HLA-FP30511 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HLA-FP30511 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HLA-FP30511 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HLA-FP30511 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HLA-FP30511 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HLA-FP30511 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
HLA-FP30511 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HLA-FP30511 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HLA-FP30511 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HLA-FP30511 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HLA-FP30511 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HLA-FP30511 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HLA-FP30511 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HLA-FP30511 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HLA-FP30511 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms