Protein–RNA interactions for Protein: P24390

KDELR1, ER lumen protein-retaining receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDELR1P24390 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
KDELR1P24390 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KDELR1P24390 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KDELR1P24390 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KDELR1P24390 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
KDELR1P24390 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KDELR1P24390 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
KDELR1P24390 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KDELR1P24390 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KDELR1P24390 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
KDELR1P24390 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KDELR1P24390 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KDELR1P24390 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
KDELR1P24390 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
KDELR1P24390 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
KDELR1P24390 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KDELR1P24390 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KDELR1P24390 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
KDELR1P24390 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
KDELR1P24390 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
KDELR1P24390 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KDELR1P24390 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KDELR1P24390 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KDELR1P24390 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
KDELR1P24390 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
KDELR1P24390 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
KDELR1P24390 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
KDELR1P24390 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KDELR1P24390 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KDELR1P24390 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KDELR1P24390 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KDELR1P24390 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
KDELR1P24390 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KDELR1P24390 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KDELR1P24390 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KDELR1P24390 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KDELR1P24390 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KDELR1P24390 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KDELR1P24390 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KDELR1P24390 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KDELR1P24390 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KDELR1P24390 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KDELR1P24390 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KDELR1P24390 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KDELR1P24390 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
KDELR1P24390 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KDELR1P24390 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KDELR1P24390 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KDELR1P24390 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KDELR1P24390 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KDELR1P24390 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KDELR1P24390 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KDELR1P24390 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KDELR1P24390 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KDELR1P24390 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KDELR1P24390 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KDELR1P24390 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KDELR1P24390 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KDELR1P24390 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KDELR1P24390 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KDELR1P24390 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KDELR1P24390 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KDELR1P24390 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KDELR1P24390 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
KDELR1P24390 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
KDELR1P24390 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KDELR1P24390 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
KDELR1P24390 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KDELR1P24390 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KDELR1P24390 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KDELR1P24390 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KDELR1P24390 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KDELR1P24390 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KDELR1P24390 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KDELR1P24390 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KDELR1P24390 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KDELR1P24390 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KDELR1P24390 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
KDELR1P24390 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KDELR1P24390 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KDELR1P24390 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KDELR1P24390 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KDELR1P24390 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KDELR1P24390 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KDELR1P24390 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KDELR1P24390 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KDELR1P24390 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KDELR1P24390 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KDELR1P24390 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
KDELR1P24390 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KDELR1P24390 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KDELR1P24390 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
KDELR1P24390 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KDELR1P24390 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KDELR1P24390 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
KDELR1P24390 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
KDELR1P24390 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KDELR1P24390 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
KDELR1P24390 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KDELR1P24390 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms