Protein–RNA interactions for Protein: P22460

KCNA5, Potassium voltage-gated channel subfamily A member 5, humanhuman

Predictions only

Length 613 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNA5P22460 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
KCNA5P22460 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
KCNA5P22460 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
KCNA5P22460 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
KCNA5P22460 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
KCNA5P22460 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
KCNA5P22460 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KCNA5P22460 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KCNA5P22460 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
KCNA5P22460 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KCNA5P22460 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
KCNA5P22460 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KCNA5P22460 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
KCNA5P22460 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KCNA5P22460 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
KCNA5P22460 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KCNA5P22460 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KCNA5P22460 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KCNA5P22460 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
KCNA5P22460 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
KCNA5P22460 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
KCNA5P22460 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KCNA5P22460 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KCNA5P22460 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KCNA5P22460 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KCNA5P22460 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KCNA5P22460 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KCNA5P22460 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
KCNA5P22460 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
KCNA5P22460 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
KCNA5P22460 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KCNA5P22460 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KCNA5P22460 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
KCNA5P22460 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
KCNA5P22460 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
KCNA5P22460 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
KCNA5P22460 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
KCNA5P22460 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
KCNA5P22460 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
KCNA5P22460 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
KCNA5P22460 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
KCNA5P22460 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
KCNA5P22460 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
KCNA5P22460 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
KCNA5P22460 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
KCNA5P22460 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
KCNA5P22460 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
KCNA5P22460 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KCNA5P22460 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
KCNA5P22460 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
KCNA5P22460 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
KCNA5P22460 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KCNA5P22460 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KCNA5P22460 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KCNA5P22460 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
KCNA5P22460 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KCNA5P22460 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
KCNA5P22460 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KCNA5P22460 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KCNA5P22460 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
KCNA5P22460 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
KCNA5P22460 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
KCNA5P22460 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
KCNA5P22460 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
KCNA5P22460 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
KCNA5P22460 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
KCNA5P22460 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KCNA5P22460 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
KCNA5P22460 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KCNA5P22460 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KCNA5P22460 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KCNA5P22460 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
KCNA5P22460 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
KCNA5P22460 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
KCNA5P22460 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KCNA5P22460 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
KCNA5P22460 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
KCNA5P22460 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
KCNA5P22460 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
KCNA5P22460 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KCNA5P22460 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
KCNA5P22460 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KCNA5P22460 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
KCNA5P22460 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
KCNA5P22460 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
KCNA5P22460 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
KCNA5P22460 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
KCNA5P22460 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
KCNA5P22460 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
KCNA5P22460 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
KCNA5P22460 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
KCNA5P22460 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
KCNA5P22460 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
KCNA5P22460 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
KCNA5P22460 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
KCNA5P22460 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
KCNA5P22460 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
KCNA5P22460 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
KCNA5P22460 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
KCNA5P22460 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms