Protein–RNA interactions for Protein: P21399

ACO1, Cytoplasmic aconitate hydratase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 889 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACO1P21399 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
ACO1P21399 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ACO1P21399 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ACO1P21399 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ACO1P21399 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ACO1P21399 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ACO1P21399 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ACO1P21399 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ACO1P21399 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ACO1P21399 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ACO1P21399 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ACO1P21399 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ACO1P21399 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ACO1P21399 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ACO1P21399 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ACO1P21399 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ACO1P21399 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ACO1P21399 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ACO1P21399 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ACO1P21399 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ACO1P21399 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
ACO1P21399 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ACO1P21399 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ACO1P21399 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
ACO1P21399 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ACO1P21399 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ACO1P21399 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
ACO1P21399 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
ACO1P21399 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ACO1P21399 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ACO1P21399 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ACO1P21399 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ACO1P21399 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ACO1P21399 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ACO1P21399 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ACO1P21399 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ACO1P21399 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ACO1P21399 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ACO1P21399 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ACO1P21399 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ACO1P21399 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ACO1P21399 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ACO1P21399 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ACO1P21399 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ACO1P21399 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ACO1P21399 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
ACO1P21399 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ACO1P21399 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ACO1P21399 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ACO1P21399 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ACO1P21399 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ACO1P21399 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ACO1P21399 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ACO1P21399 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ACO1P21399 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ACO1P21399 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ACO1P21399 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ACO1P21399 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ACO1P21399 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ACO1P21399 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ACO1P21399 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ACO1P21399 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ACO1P21399 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ACO1P21399 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ACO1P21399 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ACO1P21399 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ACO1P21399 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ACO1P21399 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ACO1P21399 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ACO1P21399 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ACO1P21399 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ACO1P21399 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ACO1P21399 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ACO1P21399 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ACO1P21399 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ACO1P21399 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ACO1P21399 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ACO1P21399 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ACO1P21399 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ACO1P21399 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ACO1P21399 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ACO1P21399 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ACO1P21399 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ACO1P21399 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ACO1P21399 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ACO1P21399 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ACO1P21399 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ACO1P21399 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ACO1P21399 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ACO1P21399 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ACO1P21399 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ACO1P21399 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ACO1P21399 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ACO1P21399 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ACO1P21399 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
ACO1P21399 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ACO1P21399 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ACO1P21399 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ACO1P21399 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ACO1P21399 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms