Protein–RNA interactions for Protein: P19474

TRIM21, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM21, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM21P19474 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TRIM21P19474 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TRIM21P19474 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TRIM21P19474 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TRIM21P19474 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TRIM21P19474 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TRIM21P19474 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TRIM21P19474 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TRIM21P19474 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TRIM21P19474 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TRIM21P19474 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TRIM21P19474 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TRIM21P19474 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TRIM21P19474 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TRIM21P19474 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TRIM21P19474 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TRIM21P19474 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TRIM21P19474 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TRIM21P19474 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TRIM21P19474 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TRIM21P19474 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TRIM21P19474 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TRIM21P19474 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TRIM21P19474 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TRIM21P19474 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TRIM21P19474 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TRIM21P19474 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TRIM21P19474 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TRIM21P19474 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TRIM21P19474 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TRIM21P19474 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TRIM21P19474 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TRIM21P19474 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TRIM21P19474 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TRIM21P19474 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TRIM21P19474 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
TRIM21P19474 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TRIM21P19474 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TRIM21P19474 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TRIM21P19474 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TRIM21P19474 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TRIM21P19474 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TRIM21P19474 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TRIM21P19474 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TRIM21P19474 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TRIM21P19474 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TRIM21P19474 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TRIM21P19474 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TRIM21P19474 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TRIM21P19474 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TRIM21P19474 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TRIM21P19474 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TRIM21P19474 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TRIM21P19474 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TRIM21P19474 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
TRIM21P19474 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TRIM21P19474 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TRIM21P19474 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TRIM21P19474 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TRIM21P19474 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TRIM21P19474 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TRIM21P19474 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TRIM21P19474 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TRIM21P19474 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TRIM21P19474 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TRIM21P19474 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TRIM21P19474 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TRIM21P19474 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TRIM21P19474 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TRIM21P19474 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TRIM21P19474 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TRIM21P19474 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TRIM21P19474 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TRIM21P19474 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TRIM21P19474 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TRIM21P19474 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TRIM21P19474 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TRIM21P19474 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TRIM21P19474 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TRIM21P19474 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TRIM21P19474 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TRIM21P19474 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TRIM21P19474 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TRIM21P19474 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TRIM21P19474 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TRIM21P19474 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TRIM21P19474 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TRIM21P19474 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TRIM21P19474 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TRIM21P19474 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TRIM21P19474 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TRIM21P19474 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TRIM21P19474 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TRIM21P19474 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRIM21P19474 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRIM21P19474 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRIM21P19474 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRIM21P19474 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRIM21P19474 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRIM21P19474 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms