Protein–RNA interactions for Protein: P19338

NCL, Nucleolin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 710 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCLP19338 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
NCLP19338 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NCLP19338 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
NCLP19338 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NCLP19338 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
NCLP19338 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
NCLP19338 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NCLP19338 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NCLP19338 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NCLP19338 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
NCLP19338 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NCLP19338 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NCLP19338 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NCLP19338 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
NCLP19338 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
NCLP19338 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NCLP19338 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NCLP19338 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
NCLP19338 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NCLP19338 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
NCLP19338 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
NCLP19338 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
NCLP19338 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
NCLP19338 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
NCLP19338 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
NCLP19338 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
NCLP19338 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
NCLP19338 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
NCLP19338 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.68
NCLP19338 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
NCLP19338 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.68
NCLP19338 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
NCLP19338 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
NCLP19338 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC25.58■■□□□ 1.68
NCLP19338 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NCLP19338 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NCLP19338 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
NCLP19338 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
NCLP19338 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NCLP19338 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NCLP19338 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NCLP19338 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
NCLP19338 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
NCLP19338 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
NCLP19338 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NCLP19338 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NCLP19338 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NCLP19338 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
NCLP19338 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NCLP19338 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
NCLP19338 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
NCLP19338 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NCLP19338 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
NCLP19338 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NCLP19338 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NCLP19338 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
NCLP19338 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
NCLP19338 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC25.56■■□□□ 1.68
NCLP19338 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NCLP19338 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NCLP19338 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NCLP19338 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
NCLP19338 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NCLP19338 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NCLP19338 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
NCLP19338 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NCLP19338 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NCLP19338 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NCLP19338 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
NCLP19338 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
NCLP19338 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
NCLP19338 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
NCLP19338 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NCLP19338 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NCLP19338 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NCLP19338 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
NCLP19338 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NCLP19338 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NCLP19338 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NCLP19338 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NCLP19338 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NCLP19338 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NCLP19338 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NCLP19338 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NCLP19338 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NCLP19338 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NCLP19338 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NCLP19338 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NCLP19338 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NCLP19338 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NCLP19338 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
NCLP19338 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
NCLP19338 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NCLP19338 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
NCLP19338 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
NCLP19338 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NCLP19338 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NCLP19338 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
NCLP19338 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NCLP19338 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms