Protein–RNA interactions for Protein: P18146

EGR1, Early growth response protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EGR1P18146 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
EGR1P18146 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
EGR1P18146 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
EGR1P18146 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
EGR1P18146 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
EGR1P18146 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
EGR1P18146 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
EGR1P18146 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
EGR1P18146 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
EGR1P18146 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
EGR1P18146 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
EGR1P18146 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
EGR1P18146 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
EGR1P18146 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
EGR1P18146 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
EGR1P18146 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
EGR1P18146 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
EGR1P18146 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
EGR1P18146 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
EGR1P18146 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
EGR1P18146 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
EGR1P18146 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
EGR1P18146 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
EGR1P18146 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
EGR1P18146 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
EGR1P18146 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
EGR1P18146 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
EGR1P18146 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
EGR1P18146 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
EGR1P18146 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
EGR1P18146 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
EGR1P18146 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
EGR1P18146 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
EGR1P18146 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
EGR1P18146 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
EGR1P18146 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
EGR1P18146 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
EGR1P18146 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
EGR1P18146 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
EGR1P18146 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
EGR1P18146 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
EGR1P18146 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
EGR1P18146 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
EGR1P18146 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
EGR1P18146 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
EGR1P18146 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
EGR1P18146 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
EGR1P18146 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
EGR1P18146 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
EGR1P18146 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
EGR1P18146 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
EGR1P18146 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
EGR1P18146 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
EGR1P18146 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
EGR1P18146 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
EGR1P18146 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
EGR1P18146 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
EGR1P18146 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
EGR1P18146 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
EGR1P18146 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
EGR1P18146 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
EGR1P18146 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
EGR1P18146 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
EGR1P18146 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
EGR1P18146 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
EGR1P18146 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
EGR1P18146 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
EGR1P18146 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
EGR1P18146 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
EGR1P18146 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
EGR1P18146 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
EGR1P18146 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
EGR1P18146 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
EGR1P18146 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
EGR1P18146 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
EGR1P18146 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
EGR1P18146 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
EGR1P18146 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
EGR1P18146 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
EGR1P18146 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
EGR1P18146 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
EGR1P18146 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
EGR1P18146 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
EGR1P18146 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
EGR1P18146 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
EGR1P18146 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
EGR1P18146 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
EGR1P18146 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
EGR1P18146 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
EGR1P18146 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
EGR1P18146 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
EGR1P18146 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
EGR1P18146 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
EGR1P18146 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
EGR1P18146 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
EGR1P18146 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
EGR1P18146 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
EGR1P18146 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
EGR1P18146 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
EGR1P18146 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms